41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2994 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2994  hypothetical protein  100 
 
 		 158 aa  302  1.0000000000000001e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.415801 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4845  protein of unknown function DUF309  61.86 
 
 		 156 aa  133  8e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0206  protein of unknown function DUF309  61.98 
 
 		 180 aa  132  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03460  protein of unknown function (DUF309)  59.17 
 
 		 158 aa  132  9.999999999999999e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5496  protein of unknown function DUF309  56.56 
 
 		 185 aa  125  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000612718  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4911  hypothetical protein  61.26 
 
 		 200 aa  123  8.000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00161519 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0133  hypothetical protein  55.83 
 
 		 165 aa  121  3e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.732285  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0964  hypothetical protein  50.33 
 
 		 158 aa  120  9e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.543165  normal  0.343587 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5333  protein of unknown function DUF309  53.62 
 
 		 494 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0481251 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5850  hypothetical protein  51.56 
 
 		 163 aa  118  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0208  hypothetical protein  47.24 
 
 		 177 aa  110  7.000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3837  hypothetical protein  47.65 
 
 		 159 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0327669  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3911  hypothetical protein  47.65 
 
 		 159 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.532008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3823  hypothetical protein  47.65 
 
 		 159 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.40568  normal  0.560252 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0473  hypothetical protein  52.25 
 
 		 149 aa  99.8  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1989  hypothetical protein  47.1 
 
 		 184 aa  97.8  6e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2231  protein of unknown function DUF309  43.94 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2921  hypothetical protein  37.84 
 
 		 130 aa  48.9  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0073  hypothetical protein  31.11 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4386  hypothetical protein  32.91 
 
 		 132 aa  46.2  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0390  protein of unknown function DUF309  41.07 
 
 		 179 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3140  protein of unknown function DUF309  34.67 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1630  hypothetical protein  42.35 
 
 		 126 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.744656  normal  0.821485 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2442  hypothetical protein  28.04 
 
 		 131 aa  45.1  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2234  protein of unknown function DUF309  35.71 
 
 		 171 aa  44.3  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.376682  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1640  hypothetical protein  35.38 
 
 		 126 aa  44.3  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.902049  normal  0.797151 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3375  hypothetical protein  26.42 
 
 		 137 aa  44.3  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.773105 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2878  hypothetical protein  33.33 
 
 		 139 aa  43.9  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1566  hypothetical protein  33.78 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.358395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08251  hypothetical protein  31.82 
 
 		 122 aa  43.9  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.584511  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2505  protein of unknown function DUF309  32.39 
 
 		 119 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.930715  normal  0.864397 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0771  hypothetical protein  31.82 
 
 		 122 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.911885  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0515  hypothetical protein  36 
 
 		 140 aa  43.1  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.905473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1551  protein of unknown function DUF309  32.43 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.683711 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1524  protein of unknown function DUF309  32.43 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2144  protein of unknown function DUF309  32.88 
 
 		 135 aa  43.1  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00366421  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3749  protein of unknown function DUF309  35.59 
 
 		 142 aa  42.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.808208 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1664  hypothetical protein  32.2 
 
 		 137 aa  42  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00161452  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1147  protein of unknown function DUF309  37.74 
 
 		 127 aa  42  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10001  hypothetical protein  27.38 
 
 		 137 aa  40.8  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.181557 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2698  hypothetical protein  31.58 
 
 		 121 aa  40.4  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.853504  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>