34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1235 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1235  GHMP kinase  100 
 
 		 280 aa  550  1e-155  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.13949  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1883  GHMP kinase  57.19 
 
 		 288 aa  268  5.9999999999999995e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0192168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0831  GHMP kinase  48.33 
 
 		 289 aa  247  2e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.680732  normal  0.0934854 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0921  pantothenate kinase  48.74 
 
 		 278 aa  241  7.999999999999999e-63  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.610677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1666  GHMP kinase  53.24 
 
 		 288 aa  238  6.999999999999999e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.024132  normal  0.466144 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2722  GHMP kinase  39.92 
 
 		 293 aa  137  2e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2679  GHMP kinase  39.38 
 
 		 277 aa  127  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1073  GHMP kinase  37.31 
 
 		 279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3255  pantothenate kinase  32.23 
 
 		 310 aa  116  5e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.343417 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1186  pantothenate kinase  31.67 
 
 		 293 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1433  GHMP kinase  34.77 
 
 		 305 aa  108  1e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3219  GHMP kinase  35.8 
 
 		 279 aa  105  7e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.858637  normal  0.612882 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0613  GHMP kinase  31.79 
 
 		 273 aa  93.2  4e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0495  GHMP kinase  35.34 
 
 		 312 aa  90.9  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.476081 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1718  GHMP kinase  25.1 
 
 		 303 aa  77.8  0.0000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0509682 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1396  GHMP kinase  26.91 
 
 		 290 aa  77.4  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0512  GHMP kinase  25.71 
 
 		 291 aa  76.3  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1240  pantothenate kinase  25.45 
 
 		 291 aa  72.4  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1385  GHMP kinase  24.32 
 
 		 281 aa  72  0.000000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.372372  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0613  pantothenate kinase  29.41 
 
 		 247 aa  68.9  0.00000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.821788 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0620  GHMP kinase  24.36 
 
 		 274 aa  67.8  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1785  GHMP kinase  28.82 
 
 		 291 aa  63.9  0.000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.564621 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0382  pantothenate kinase  28.17 
 
 		 278 aa  55.5  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0437123 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1364  hypothetical protein  29.78 
 
 		 258 aa  54.7  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00000668335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1051  GHMP kinase  33.58 
 
 		 296 aa  53.1  0.000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.265413  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0312  hypothetical protein  29.78 
 
 		 255 aa  52  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.11575  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0204  GHMP kinase  29.79 
 
 		 270 aa  52  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1421  mevalonate kinase  32 
 
 		 301 aa  47  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.238571  hitchhiker  0.00767711 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2002  hypothetical protein  32.64 
 
 		 257 aa  45.1  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0456  phosphomevalonate kinase  27.22 
 
 		 329 aa  45.1  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5432  4-diphosphocytidyl-2-C-methyl-D-erythritol kinase  27.78 
 
 		 287 aa  44.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0681  mevalonate kinase  31.34 
 
 		 290 aa  44.7  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2815  galactokinase  30.56 
 
 		 359 aa  44.3  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.113081 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2213  mevalonate kinase  26.56 
 
 		 289 aa  43.5  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>