26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0613 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_0613  pantothenate kinase  100 
 
 
247 aa  496  1e-139  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.821788 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0204  GHMP kinase  47.58 
 
 
270 aa  242  3.9999999999999997e-63  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1785  GHMP kinase  28.68 
 
 
291 aa  107  1e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.564621 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0382  pantothenate kinase  35.56 
 
 
278 aa  107  2e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0437123 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1364  hypothetical protein  32.7 
 
 
258 aa  90.1  3e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00000668335  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0312  hypothetical protein  32.26 
 
 
255 aa  90.1  3e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.11575  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2002  hypothetical protein  29.68 
 
 
257 aa  80.5  0.00000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1186  pantothenate kinase  29.68 
 
 
293 aa  80.5  0.00000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3219  GHMP kinase  30 
 
 
279 aa  78.2  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.858637  normal  0.612882 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1073  GHMP kinase  28.19 
 
 
279 aa  73.2  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2722  GHMP kinase  27.39 
 
 
293 aa  73.6  0.000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3255  pantothenate kinase  25.7 
 
 
310 aa  73.2  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.343417 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0831  GHMP kinase  30.13 
 
 
289 aa  71.6  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.680732  normal  0.0934854 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2679  GHMP kinase  32.45 
 
 
277 aa  70.1  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0613  GHMP kinase  29.85 
 
 
273 aa  68.2  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0620  GHMP kinase  24.66 
 
 
274 aa  66.2  0.0000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1240  pantothenate kinase  26.25 
 
 
291 aa  62.8  0.000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1235  GHMP kinase  29.41 
 
 
280 aa  62.4  0.000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.13949  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1385  GHMP kinase  25.64 
 
 
281 aa  60.5  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.372372  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1433  GHMP kinase  26.42 
 
 
305 aa  60.8  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1396  GHMP kinase  26.25 
 
 
290 aa  60.1  0.00000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0512  GHMP kinase  26.56 
 
 
291 aa  59.3  0.00000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1883  GHMP kinase  25.64 
 
 
288 aa  55.1  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0192168  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0495  GHMP kinase  23.7 
 
 
312 aa  45.4  0.0008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.476081 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0921  pantothenate kinase  27.27 
 
 
278 aa  44.7  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.610677  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1718  GHMP kinase  32.61 
 
 
303 aa  42.7  0.006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0509682 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>