28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0495 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0495  GHMP kinase  100 
 
 
312 aa  594  1e-169  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.476081 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2679  GHMP kinase  58.5 
 
 
277 aa  294  1e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1073  GHMP kinase  56.21 
 
 
279 aa  281  1e-74  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2722  GHMP kinase  51.62 
 
 
293 aa  257  2e-67  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3219  GHMP kinase  50.66 
 
 
279 aa  233  3e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.858637  normal  0.612882 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3255  pantothenate kinase  37.41 
 
 
310 aa  155  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.343417 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1186  pantothenate kinase  34.4 
 
 
293 aa  129  7.000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1433  GHMP kinase  38.73 
 
 
305 aa  120  3e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1240  pantothenate kinase  30.43 
 
 
291 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1718  GHMP kinase  27.02 
 
 
303 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0509682 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0512  GHMP kinase  29.47 
 
 
291 aa  117  3e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1396  GHMP kinase  31.76 
 
 
290 aa  117  3e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1385  GHMP kinase  30.23 
 
 
281 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.372372  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0831  GHMP kinase  30.48 
 
 
289 aa  100  4e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.680732  normal  0.0934854 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0620  GHMP kinase  26.28 
 
 
274 aa  95.9  8e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0921  pantothenate kinase  31.25 
 
 
278 aa  91.3  2e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.610677  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1235  GHMP kinase  34.63 
 
 
280 aa  89.7  5e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.13949  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0382  pantothenate kinase  30.82 
 
 
278 aa  87  3e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0437123 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1883  GHMP kinase  34.84 
 
 
288 aa  87  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0192168  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1785  GHMP kinase  27.84 
 
 
291 aa  83.2  0.000000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.564621 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1666  GHMP kinase  31.51 
 
 
288 aa  79.3  0.00000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.024132  normal  0.466144 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0613  GHMP kinase  26.4 
 
 
273 aa  74.7  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1051  GHMP kinase  31.1 
 
 
296 aa  65.9  0.0000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.265413  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0204  GHMP kinase  30.34 
 
 
270 aa  58.2  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0613  pantothenate kinase  23.7 
 
 
247 aa  57.8  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.821788 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0312  hypothetical protein  28.08 
 
 
255 aa  57.4  0.0000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.11575  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2002  hypothetical protein  31.65 
 
 
257 aa  55.5  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1364  hypothetical protein  27.52 
 
 
258 aa  54.3  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00000668335  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>