28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_1396 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_1396  GHMP kinase  100 
 
 
290 aa  592  1e-168  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0512  GHMP kinase  93.47 
 
 
291 aa  556  1e-157  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1240  pantothenate kinase  92.78 
 
 
291 aa  552  1e-156  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1385  GHMP kinase  75.43 
 
 
281 aa  450  1e-125  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.372372  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0620  GHMP kinase  54.73 
 
 
274 aa  315  6e-85  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3255  pantothenate kinase  36.36 
 
 
310 aa  153  4e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.343417 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2722  GHMP kinase  31.85 
 
 
293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1186  pantothenate kinase  33.95 
 
 
293 aa  132  5e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1073  GHMP kinase  32.32 
 
 
279 aa  124  1e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2679  GHMP kinase  30.95 
 
 
277 aa  122  6e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1433  GHMP kinase  32.12 
 
 
305 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3219  GHMP kinase  29.52 
 
 
279 aa  107  3e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.858637  normal  0.612882 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0831  GHMP kinase  30.25 
 
 
289 aa  100  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.680732  normal  0.0934854 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0495  GHMP kinase  29.47 
 
 
312 aa  99.8  5e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.476081 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1718  GHMP kinase  28.47 
 
 
303 aa  99  8e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0509682 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0613  GHMP kinase  30.36 
 
 
273 aa  87.8  2e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1785  GHMP kinase  28.28 
 
 
291 aa  83.6  0.000000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.564621 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0921  pantothenate kinase  27.55 
 
 
278 aa  83.6  0.000000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.610677  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1883  GHMP kinase  25.52 
 
 
288 aa  83.2  0.000000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0192168  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0382  pantothenate kinase  28.28 
 
 
278 aa  80.9  0.00000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0437123 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1051  GHMP kinase  27.93 
 
 
296 aa  79  0.00000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.265413  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0204  GHMP kinase  27.8 
 
 
270 aa  75.1  0.000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2002  hypothetical protein  26.83 
 
 
257 aa  73.6  0.000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1364  hypothetical protein  23.88 
 
 
258 aa  68.6  0.0000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00000668335  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1235  GHMP kinase  26.18 
 
 
280 aa  68.2  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.13949  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0312  hypothetical protein  24.35 
 
 
255 aa  63.2  0.000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.11575  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1666  GHMP kinase  24.73 
 
 
288 aa  62.8  0.000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.024132  normal  0.466144 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0613  pantothenate kinase  26.25 
 
 
247 aa  60.1  0.00000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.821788 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>