28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0613 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0613  GHMP kinase  100 
 
 
273 aa  556  1e-157  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3255  pantothenate kinase  35.06 
 
 
310 aa  133  3e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.343417 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1186  pantothenate kinase  32.93 
 
 
293 aa  124  2e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1433  GHMP kinase  31.56 
 
 
305 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1785  GHMP kinase  29.03 
 
 
291 aa  108  1e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.564621 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2722  GHMP kinase  29.85 
 
 
293 aa  100  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0831  GHMP kinase  31.5 
 
 
289 aa  99  7e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.680732  normal  0.0934854 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1396  GHMP kinase  30.36 
 
 
290 aa  97.4  2e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2679  GHMP kinase  27.63 
 
 
277 aa  96.3  5e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1385  GHMP kinase  30.07 
 
 
281 aa  94.4  2e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.372372  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3219  GHMP kinase  29.61 
 
 
279 aa  93.6  3e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.858637  normal  0.612882 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1235  GHMP kinase  31.18 
 
 
280 aa  91.3  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.13949  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0512  GHMP kinase  29.18 
 
 
291 aa  92  1e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1240  pantothenate kinase  28.32 
 
 
291 aa  90.1  3e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0382  pantothenate kinase  27.7 
 
 
278 aa  87.8  2e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0437123 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0620  GHMP kinase  29.92 
 
 
274 aa  85.1  0.000000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0921  pantothenate kinase  27.55 
 
 
278 aa  83.2  0.000000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.610677  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1073  GHMP kinase  28.03 
 
 
279 aa  82.4  0.000000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0613  pantothenate kinase  29.85 
 
 
247 aa  79.7  0.00000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.821788 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0495  GHMP kinase  26.73 
 
 
312 aa  74.3  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.476081 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1666  GHMP kinase  28.62 
 
 
288 aa  66.2  0.0000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.024132  normal  0.466144 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1051  GHMP kinase  28.35 
 
 
296 aa  65.9  0.0000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.265413  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1718  GHMP kinase  27.83 
 
 
303 aa  62  0.000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0509682 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1883  GHMP kinase  27.41 
 
 
288 aa  58.5  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0192168  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2002  hypothetical protein  28.05 
 
 
257 aa  55.5  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1364  hypothetical protein  26.22 
 
 
258 aa  52.8  0.000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00000668335  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0204  GHMP kinase  29.86 
 
 
270 aa  52.8  0.000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0312  hypothetical protein  28.21 
 
 
255 aa  49.7  0.00006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.11575  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>