27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1666 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_1666  GHMP kinase  100 
 
 
288 aa  574  1.0000000000000001e-163  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.024132  normal  0.466144 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1883  GHMP kinase  53.24 
 
 
288 aa  246  4e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0192168  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0831  GHMP kinase  44.76 
 
 
289 aa  238  1e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.680732  normal  0.0934854 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1235  GHMP kinase  53.24 
 
 
280 aa  229  5e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.13949  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0921  pantothenate kinase  46.1 
 
 
278 aa  210  2e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.610677  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2722  GHMP kinase  36.26 
 
 
293 aa  118  9.999999999999999e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1073  GHMP kinase  34.87 
 
 
279 aa  112  5e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3255  pantothenate kinase  30.96 
 
 
310 aa  108  8.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.343417 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2679  GHMP kinase  33.59 
 
 
277 aa  104  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1433  GHMP kinase  32.27 
 
 
305 aa  95.5  8e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3219  GHMP kinase  32.17 
 
 
279 aa  93.2  5e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.858637  normal  0.612882 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1186  pantothenate kinase  29.29 
 
 
293 aa  89.7  5e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0495  GHMP kinase  31.51 
 
 
312 aa  80.1  0.00000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.476081 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1718  GHMP kinase  26.32 
 
 
303 aa  76.6  0.0000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0509682 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0613  GHMP kinase  25.62 
 
 
273 aa  68.6  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0620  GHMP kinase  26.42 
 
 
274 aa  68.6  0.0000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1396  GHMP kinase  25.81 
 
 
290 aa  66.2  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1385  GHMP kinase  26.18 
 
 
281 aa  63.2  0.000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.372372  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1785  GHMP kinase  34.97 
 
 
291 aa  61.2  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.564621 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0382  pantothenate kinase  29.13 
 
 
278 aa  60.8  0.00000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0437123 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0512  GHMP kinase  25.35 
 
 
291 aa  60.5  0.00000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1240  pantothenate kinase  25.45 
 
 
291 aa  59.7  0.00000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1364  hypothetical protein  27.51 
 
 
258 aa  49.3  0.00007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00000668335  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0312  hypothetical protein  27 
 
 
255 aa  48.9  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.11575  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2002  hypothetical protein  29.75 
 
 
257 aa  48.1  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0613  pantothenate kinase  26.03 
 
 
247 aa  45.8  0.0007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.821788 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0476  mevalonate kinase  29.5 
 
 
321 aa  43.5  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>