More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2838 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_2838  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  100 
 
 
247 aa  514  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0236915  normal  0.339029 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2615  hypothetical protein  98.38 
 
 
247 aa  509  1e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0980997 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2645  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  94.74 
 
 
247 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2930  hypothetical protein  88.66 
 
 
247 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.656633  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5817  hypothetical protein  66.4 
 
 
247 aa  361  5.0000000000000005e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.537036  normal  0.103138 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1269  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  66.94 
 
 
247 aa  354  6.999999999999999e-97  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5429  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  63.16 
 
 
256 aa  341  8e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1176  putative oxidoreductase  62.75 
 
 
247 aa  323  1e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.199647  normal  0.198576 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2946  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  52.05 
 
 
244 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4922  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  52.24 
 
 
246 aa  272  4.0000000000000004e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00884029  normal  0.244151 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5743  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  52.03 
 
 
259 aa  271  5.000000000000001e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.044378 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0695  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  53.88 
 
 
244 aa  271  1e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.282558  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4212  hypothetical protein  49.79 
 
 
246 aa  254  8e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.675122  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3932  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  49.19 
 
 
245 aa  250  1e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.38362 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3065  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  48.79 
 
 
247 aa  243  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.898209  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3622  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  47.24 
 
 
257 aa  240  2e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3173  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  49.19 
 
 
247 aa  236  3e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2975  hypothetical protein  48.79 
 
 
259 aa  232  4.0000000000000004e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.309186  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1437  hypothetical protein  45.82 
 
 
247 aa  229  2e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1171  oxidoreductase, putative  45.68 
 
 
246 aa  225  4e-58  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1375  hypothetical protein  45.75 
 
 
247 aa  208  6e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.722057 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3009  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  45.34 
 
 
247 aa  208  8e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000854394 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1338  hypothetical protein  45.34 
 
 
247 aa  208  8e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1352  hypothetical protein  45.34 
 
 
247 aa  207  8e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1270  hypothetical protein  44.53 
 
 
247 aa  207  1e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2809  hypothetical protein  44.94 
 
 
247 aa  205  5e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2996  hypothetical protein  44.53 
 
 
247 aa  205  5e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2906  hypothetical protein  44.94 
 
 
258 aa  205  5e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.327567 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1520  hypothetical protein  44.53 
 
 
247 aa  205  6e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2736  hypothetical protein  44.94 
 
 
247 aa  205  6e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2441  hypothetical protein  44.58 
 
 
247 aa  202  5e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.175733  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1852  hypothetical protein  44 
 
 
248 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3004  hypothetical protein  43.72 
 
 
247 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.609056  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37080  Fe-S oxidoreductase  42.56 
 
 
243 aa  193  2e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.151092  normal  0.0205493 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2722  hypothetical protein  42.8 
 
 
242 aa  192  3e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.451695  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3243  hypothetical protein  43.27 
 
 
234 aa  191  1e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.496148  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3924  hypothetical protein  43.32 
 
 
247 aa  189  5e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3606  hypothetical protein  40 
 
 
270 aa  188  8e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2709  hypothetical protein  41.94 
 
 
248 aa  188  8e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.270424  normal  0.129266 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0140  hypothetical protein  39.92 
 
 
263 aa  187  2e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3038  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  41.9 
 
 
246 aa  187  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5452  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  42.91 
 
 
239 aa  185  7e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.625319 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1216  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  41.94 
 
 
244 aa  184  8e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.770234  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2593  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  40.08 
 
 
270 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.128565  normal  0.0827191 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3704  hypothetical protein  40.55 
 
 
246 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.475833  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7370  cysteine-rich domain protein  39.77 
 
 
250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660622  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1462  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  40.91 
 
 
227 aa  183  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0836578  normal  0.704766 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4815  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  39.76 
 
 
247 aa  181  9.000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12950  Fe-S oxidoreductase  42.19 
 
 
261 aa  181  1e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0443672  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1905  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  40.65 
 
 
245 aa  181  1e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2452  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  42.23 
 
 
247 aa  179  2.9999999999999997e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.345477  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1034  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  42.23 
 
 
249 aa  178  7e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.92586  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5226  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  41.43 
 
 
249 aa  178  7e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2898  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  43.78 
 
 
246 aa  178  9e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.129915  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3563  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  41.43 
 
 
249 aa  177  1e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0102494  hitchhiker  0.00479184 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04070  Fe-S oxidoreductase  41.13 
 
 
244 aa  177  1e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0880878 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2995  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  40 
 
 
246 aa  176  4e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0367  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  37.9 
 
 
259 aa  176  4e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1274  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  39.27 
 
 
239 aa  175  6e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0717  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  39.04 
 
 
248 aa  173  1.9999999999999998e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1755  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  40.56 
 
 
257 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0392  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  38.31 
 
 
238 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0967  hypothetical protein  39.11 
 
 
245 aa  172  5e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3730  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  40.94 
 
 
249 aa  171  1e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0542099  normal  0.363647 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2282  hypothetical protein  38.55 
 
 
260 aa  170  2e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.293484  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0079  hypothetical protein  38.46 
 
 
260 aa  170  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.376514  unclonable  0.0000154463 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2001  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  41.63 
 
 
237 aa  169  5e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000985814  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4766  hypothetical protein  40.64 
 
 
251 aa  168  9e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4385  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  40.64 
 
 
251 aa  168  9e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4472  hypothetical protein  40.64 
 
 
251 aa  168  9e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.783879 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1354  hypothetical protein  40.56 
 
 
239 aa  167  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1416  hypothetical protein  39.76 
 
 
239 aa  167  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1216  hypothetical protein  39.76 
 
 
239 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0407054  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1194  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, iron-sulfur subunit  39.76 
 
 
239 aa  167  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1196  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, iron-sulfur subunit  39.76 
 
 
239 aa  167  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0498426  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1315  hypothetical protein  39.76 
 
 
239 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1456  hypothetical protein  39.76 
 
 
239 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1206  hypothetical protein  38.1 
 
 
241 aa  165  5e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.546437  normal  0.272976 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1024  hypothetical protein  38.46 
 
 
239 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1392  hypothetical protein  39.36 
 
 
239 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2425  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  38.89 
 
 
244 aa  165  6.9999999999999995e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00338747  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1896  Fe-S oxidoreductase  36.44 
 
 
256 aa  164  9e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.138109  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3990  hypothetical protein  40.16 
 
 
239 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.441671  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1218  hypothetical protein  39.76 
 
 
239 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0555  Fe-S oxidoreductase  36.55 
 
 
268 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1873  hypothetical protein  36.14 
 
 
289 aa  162  6e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1437  oxidoreductase  38.21 
 
 
246 aa  162  6e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.147364  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0458  hypothetical protein  36.14 
 
 
268 aa  162  7e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1431  hypothetical protein  36.14 
 
 
268 aa  162  7e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.667811  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2182  hypothetical protein  36.14 
 
 
268 aa  162  7e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0867  hypothetical protein  36.14 
 
 
268 aa  162  7e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.258503  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1935  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  36.9 
 
 
241 aa  161  9e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.907916  normal  0.0152527 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05130  Fe-S oxidoreductase  37.07 
 
 
267 aa  160  1e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1310  hypothetical protein  37.3 
 
 
241 aa  160  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1607  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  37.3 
 
 
241 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.096074  normal  0.366344 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2080  hypothetical protein  36.47 
 
 
268 aa  159  4e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.945675  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1413  hypothetical protein  39.67 
 
 
249 aa  158  6e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.170159  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3164  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  36.69 
 
 
256 aa  157  1e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1611  hypothetical protein  36.9 
 
 
241 aa  156  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0746419  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3104  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  38.19 
 
 
267 aa  157  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>