More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2898 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_2898  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  100 
 
 
246 aa  507  1e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.129915  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2709  hypothetical protein  78.37 
 
 
248 aa  394  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.270424  normal  0.129266 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3704  hypothetical protein  77.92 
 
 
246 aa  394  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.475833  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04070  Fe-S oxidoreductase  71.31 
 
 
244 aa  368  1e-101  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0880878 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1034  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  64.52 
 
 
249 aa  326  2.0000000000000001e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.92586  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4815  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  65.45 
 
 
247 aa  326  2.0000000000000001e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5226  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  63.71 
 
 
249 aa  325  4.0000000000000003e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05130  Fe-S oxidoreductase  65.06 
 
 
267 aa  324  1e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37080  Fe-S oxidoreductase  65.84 
 
 
243 aa  322  4e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.151092  normal  0.0205493 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4385  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  66.94 
 
 
251 aa  322  5e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4766  hypothetical protein  66.94 
 
 
251 aa  322  5e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4472  hypothetical protein  66.94 
 
 
251 aa  322  5e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.783879 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3563  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  62.9 
 
 
249 aa  319  1.9999999999999998e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0102494  hitchhiker  0.00479184 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3038  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  62.96 
 
 
246 aa  318  7e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1462  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  65.98 
 
 
227 aa  315  4e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0836578  normal  0.704766 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3730  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  63.71 
 
 
249 aa  313  9.999999999999999e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0542099  normal  0.363647 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7370  cysteine-rich domain protein  64.37 
 
 
250 aa  313  1.9999999999999998e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660622  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0891  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  61.85 
 
 
264 aa  308  5.9999999999999995e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.147863  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2452  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  61.22 
 
 
247 aa  303  1.0000000000000001e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.345477  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2593  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  61.79 
 
 
270 aa  301  7.000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.128565  normal  0.0827191 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3104  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  59.27 
 
 
267 aa  300  1e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3243  hypothetical protein  62.81 
 
 
234 aa  299  3e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.496148  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1755  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  62.81 
 
 
257 aa  298  8e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12950  Fe-S oxidoreductase  59.27 
 
 
261 aa  287  9e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0443672  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2425  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  60.08 
 
 
244 aa  284  8e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00338747  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2001  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  61.89 
 
 
237 aa  280  1e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000985814  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19840  Fe-S oxidoreductase  50 
 
 
284 aa  249  3e-65  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0717  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  53.33 
 
 
248 aa  248  5e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0392  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  44.58 
 
 
238 aa  215  5e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1274  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  46.22 
 
 
239 aa  212  4.9999999999999996e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0695  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  47.62 
 
 
244 aa  208  6e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.282558  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2722  hypothetical protein  45.42 
 
 
242 aa  207  9e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.451695  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1216  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  46.06 
 
 
244 aa  207  1e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.770234  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3622  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  43.48 
 
 
257 aa  200  1.9999999999999998e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3263  hypothetical protein  38.33 
 
 
242 aa  199  3e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2958  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, iron-sulfur subunit  38.75 
 
 
242 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0367  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  44.12 
 
 
259 aa  198  5e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3037  hypothetical protein  37.92 
 
 
242 aa  198  7e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.291586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3270  hypothetical protein  37.92 
 
 
242 aa  198  7e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3259  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  38.75 
 
 
240 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0140  hypothetical protein  44.9 
 
 
263 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1437  hypothetical protein  44.44 
 
 
247 aa  196  3e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2946  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  41.77 
 
 
244 aa  195  7e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00262  predicted oxidoreductase  43.15 
 
 
239 aa  194  1e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3299  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  43.15 
 
 
239 aa  194  1e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00266  hypothetical protein  43.15 
 
 
239 aa  194  1e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3065  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  44.62 
 
 
247 aa  194  1e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.898209  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0338  hypothetical protein  43.15 
 
 
239 aa  194  2e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0359  cysteine-rich domain protein  43.15 
 
 
239 aa  193  3e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.477523 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1896  Fe-S oxidoreductase  40.91 
 
 
256 aa  192  4e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.138109  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1354  hypothetical protein  42.92 
 
 
239 aa  192  6e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0259  cysteine-rich domain protein  42.74 
 
 
239 aa  191  7e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3316  hypothetical protein  42.74 
 
 
239 aa  191  7e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0359  hypothetical protein  42.74 
 
 
239 aa  191  9e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.368337  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2718  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  44.35 
 
 
247 aa  191  9e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0321  hypothetical protein  42.74 
 
 
239 aa  191  9e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2838  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  43.78 
 
 
247 aa  190  1e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0236915  normal  0.339029 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1024  hypothetical protein  42.92 
 
 
239 aa  191  1e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2615  hypothetical protein  43.37 
 
 
247 aa  190  2e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0980997 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1218  hypothetical protein  42.08 
 
 
239 aa  189  4e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0079  hypothetical protein  40.25 
 
 
260 aa  189  4e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.376514  unclonable  0.0000154463 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3990  hypothetical protein  42.5 
 
 
239 aa  189  5e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.441671  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1392  hypothetical protein  41.67 
 
 
239 aa  188  7e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5817  hypothetical protein  44.98 
 
 
247 aa  188  8e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.537036  normal  0.103138 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0709  hypothetical protein  38.78 
 
 
243 aa  188  8e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.162619  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1416  hypothetical protein  41.67 
 
 
239 aa  187  9e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1216  hypothetical protein  41.67 
 
 
239 aa  187  9e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0407054  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1194  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, iron-sulfur subunit  41.67 
 
 
239 aa  187  9e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1196  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, iron-sulfur subunit  41.67 
 
 
239 aa  187  9e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0498426  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1315  hypothetical protein  41.67 
 
 
239 aa  187  9e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1456  hypothetical protein  41.67 
 
 
239 aa  187  9e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5743  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  40.4 
 
 
259 aa  187  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.044378 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0967  hypothetical protein  38.11 
 
 
245 aa  187  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2930  hypothetical protein  44.98 
 
 
247 aa  187  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.656633  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2080  hypothetical protein  43.67 
 
 
268 aa  187  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.945675  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05530  Fe-S oxidoreductase  38.8 
 
 
248 aa  186  3e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2645  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  42.97 
 
 
247 aa  186  3e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5452  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  40.83 
 
 
239 aa  186  3e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.625319 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3173  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  45.42 
 
 
247 aa  186  4e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2182  hypothetical protein  43.67 
 
 
268 aa  185  5e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1431  hypothetical protein  43.67 
 
 
268 aa  185  5e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.667811  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4922  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  39.84 
 
 
246 aa  185  5e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00884029  normal  0.244151 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1873  hypothetical protein  43.67 
 
 
289 aa  185  5e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0867  hypothetical protein  43.67 
 
 
268 aa  185  5e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.258503  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0458  hypothetical protein  43.67 
 
 
268 aa  185  5e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1234  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  40.66 
 
 
239 aa  184  8e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.399981  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4458  hypothetical protein  42.26 
 
 
247 aa  183  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.169961 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0555  Fe-S oxidoreductase  43.27 
 
 
268 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0810  hypothetical protein  42.68 
 
 
249 aa  183  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0233285 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5429  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  43.37 
 
 
256 aa  182  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2995  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  42.5 
 
 
246 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2768  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  40.66 
 
 
239 aa  181  1e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3932  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  37.94 
 
 
245 aa  180  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.38362 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4212  hypothetical protein  37.8 
 
 
246 aa  180  2e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.675122  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2975  hypothetical protein  44.22 
 
 
259 aa  179  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.309186  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2926  hypothetical protein  42.19 
 
 
256 aa  178  4.999999999999999e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0345775  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1176  putative oxidoreductase  43.37 
 
 
247 aa  178  9e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.199647  normal  0.198576 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2677  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  39.42 
 
 
239 aa  177  1e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1749  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  39.42 
 
 
239 aa  177  2e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0856492  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0375  hypothetical protein  40.91 
 
 
289 aa  176  3e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000724873  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>