40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1239 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_1239  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  100 
 
 
79 aa  144  5e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0390  A1AO H+ ATPase subunit K  78.48 
 
 
81 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0378  A1AO H+ ATPase subunit K  77.22 
 
 
81 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0283  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  68.66 
 
 
82 aa  87.4  5e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.319058  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1179  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  70.31 
 
 
85 aa  84.3  5e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00560744  normal  0.523004 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2681  H+transporting two-sector ATPase C subunit  67.19 
 
 
93 aa  82.8  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0243152  normal  0.117564 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1218  hypothetical protein  63.08 
 
 
83 aa  78.2  0.00000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000000000445422  normal  0.214233 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2349  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  70.15 
 
 
82 aa  74.3  0.0000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.211164 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1613  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  53.12 
 
 
85 aa  68.2  0.00000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.466699  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1433  A-type ATP synthase subunit K  61.4 
 
 
68 aa  67.4  0.00000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3349  hypothetical protein  61.7 
 
 
88 aa  60.8  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0277  H+transporting two-sector ATPase C subunit  63.64 
 
 
83 aa  57.4  0.00000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.571155 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0061  V-type ATP synthase subunit K  46.27 
 
 
223 aa  54.7  0.0000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1266  H(+)-transporting two-sector ATPase  50 
 
 
606 aa  53.9  0.0000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0553  V-type ATP synthase subunit K  44.78 
 
 
222 aa  53.1  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.651546  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0294  V-type ATP synthase subunit K  44.78 
 
 
222 aa  53.1  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.620174 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1014  H+transporting two-sector ATPase C subunit  42.19 
 
 
142 aa  52.8  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1619  V-type ATP synthase subunit K  44.78 
 
 
222 aa  53.1  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.573628  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0419  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  51.72 
 
 
70 aa  52.4  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0363  V-type ATP synthase subunit K  44.78 
 
 
222 aa  52.8  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.100605  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1774  V-type ATP synthase subunit K  41.67 
 
 
232 aa  50.4  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2767  H+transporting two-sector ATPase C subunit  46.03 
 
 
71 aa  50.4  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000764187  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1198  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  46.03 
 
 
71 aa  50.4  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0357317  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2672  H+transporting two-sector ATPase C subunit  46.03 
 
 
71 aa  50.4  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.000356712  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2568  H+transporting two-sector ATPase C subunit  44.44 
 
 
71 aa  50.1  0.000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0859386  normal  0.3596 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1449  H+transporting two-sector ATPase C subunit  47.3 
 
 
100 aa  48.9  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0399378  normal  0.449211 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1277  H+transporting two-sector ATPase C subunit  67.39 
 
 
85 aa  47.8  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1105  H+transporting two-sector ATPase C subunit  43.75 
 
 
142 aa  46.2  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0520  H+transporting two-sector ATPase C subunit  43.08 
 
 
139 aa  45.1  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69588  vacuolar ATPase V0 domain subunit c  37.88 
 
 
160 aa  43.5  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.406866 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1688  H+transporting two-sector ATPase C subunit  39.68 
 
 
102 aa  42.4  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.422777 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06127  vacuolar ATP synthase 16 kDa proteolipid subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12370)  39.06 
 
 
151 aa  42  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03340  hydrogen ion transporter, putative  36.92 
 
 
190 aa  41.6  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.000569268  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21882  predicted protein  35.38 
 
 
170 aa  41.6  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.854238  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_29011  predicted protein  35.38 
 
 
170 aa  41.6  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00069003  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03088  hypothetical protein similar to vacuolar ATP synthase 16 kDa proteolipid subunit (Broad)  39.06 
 
 
161 aa  41.6  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1807  v-type ATPase, subunit K  37.33 
 
 
158 aa  41.2  0.005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1763  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  48.94 
 
 
76 aa  40.8  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1690  V-type ATP synthase subunit K  37.5 
 
 
156 aa  40.4  0.007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02690  conserved hypothetical protein  36.36 
 
 
164 aa  40  0.01  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.372829  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>