76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0405 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007633  MCAP_0405  tRNA-Tyr  100 
 
 		 84 bp  167  5e-40  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.283193  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R25  tRNA-Tyr  96.43 
 
 		 84 bp  143  7e-33  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt013  tRNA-Tyr  95.24 
 
 		 84 bp  135  1.9999999999999998e-30  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0080367  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0046  tRNA-Tyr  87.06 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0100  tRNA-Tyr  86.59 
 
 		 82 bp  67.9  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0037  tRNA-Tyr  85.88 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.216376  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0109  tRNA-Tyr  85.37 
 
 		 82 bp  60  0.00000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.22534  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2567  tRNA-Tyr  84.42 
 
 		 81 bp  58  0.0000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0090  tRNA-Tyr  84.42 
 
 		 81 bp  58  0.0000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0086  tRNA-Tyr  100 
 
 		 84 bp  56  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00209074  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Tyr-1  tRNA-Tyr  100 
 
 		 84 bp  56  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0779  tRNA-Tyr  100 
 
 		 84 bp  56  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.74653e-30 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0044  tRNA-Tyr  100 
 
 		 82 bp  56  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0075  tRNA-Tyr  100 
 
 		 84 bp  56  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0044  tRNA-Tyr  100 
 
 		 81 bp  56  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0075  tRNA-Tyr  100 
 
 		 84 bp  56  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0037  tRNA-Tyr  100 
 
 		 84 bp  56  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000436078  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0082  tRNA-Tyr  100 
 
 		 84 bp  56  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000708983  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0094  tRNA-Tyr  100 
 
 		 84 bp  56  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000196241  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0533  tRNA-Tyr  100 
 
 		 84 bp  56  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.30142e-31 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0037  tRNA-Tyr  100 
 
 		 84 bp  56  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.274575  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4769  tRNA-Tyr  100 
 
 		 84 bp  56  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000283777  hitchhiker  6.00721e-16 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0098  tRNA-Tyr  100 
 
 		 84 bp  56  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157171  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0171  tRNA-Tyr  100 
 
 		 84 bp  56  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0235528 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0192  tRNA-Tyr  100 
 
 		 84 bp  56  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000718643  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0608  tRNA-Tyr  100 
 
 		 84 bp  56  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000101667  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5144  tRNA-Tyr  100 
 
 		 84 bp  56  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000379395  normal  0.810906 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0854  tRNA-Tyr  100 
 
 		 84 bp  56  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000540408  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5654  tRNA-Tyr  100 
 
 		 84 bp  56  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000770795  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5714  tRNA-Tyr  100 
 
 		 84 bp  56  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000564406  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5726  tRNA-Tyr  100 
 
 		 84 bp  56  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000809965  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4577  tRNA-Tyr  100 
 
 		 84 bp  56  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000592849  normal  0.083174 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Tyr-2  tRNA-Tyr  100 
 
 		 84 bp  56  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5651  tRNA-Tyr  100 
 
 		 84 bp  56  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000725819  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5679  tRNA-Tyr  100 
 
 		 84 bp  56  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000538647  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5688  tRNA-Tyr  100 
 
 		 84 bp  56  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000511712  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Tyr-1  tRNA-Tyr  100 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000180977  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Tyr-2  tRNA-Tyr  100 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000316602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Tyr-1  tRNA-Tyr  100 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0154705  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Tyr-2  tRNA-Tyr  100 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000292226  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Tyr-3  tRNA-Tyr  100 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000395282  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Tyr-1  tRNA-Tyr  100 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000397446  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Tyr-2  tRNA-Tyr  100 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00144807  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Tyr-3  tRNA-Tyr  100 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000630573  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Tyr-2  tRNA-Tyr  100 
 
 		 84 bp  56  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000017627  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Tyr-1  tRNA-Tyr  100 
 
 		 84 bp  56  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117276  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0044  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  50.1  0.00008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.919429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0007  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  50.1  0.00008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000441599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0028  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  50.1  0.00008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.208638  hitchhiker  0.00938841 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0004  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0554564  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0045  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000000150485  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Tyr-1  tRNA-Tyr  100 
 
 		 81 bp  44.1  0.005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000135792  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0004  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0045  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0008  tRNA-Ser  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0909337  hitchhiker  0.00840657 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1169  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  44.1  0.005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000109978  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0037  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  44.1  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Ser-4  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  44.1  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.110057  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0004  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0637  tRNA-Tyr  100 
 
 		 81 bp  44.1  0.005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000000210414  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0038  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  44.1  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0059  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA5  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0419374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0026  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23198  normal  0.0533139 
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Tyr-2  tRNA-Tyr  100 
 
 		 81 bp  44.1  0.005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.875932  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Tyr-3  tRNA-Tyr  100 
 
 		 81 bp  44.1  0.005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t35  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0061  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.318482  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0009  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.4364  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1783  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.762858  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0016  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0003  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0003  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0002  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0003  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.642958  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0008    96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0798492  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>