176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_t0637 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  tRNA-Tyr-2  tRNA-Tyr  100 
 
 		 81 bp  161  3e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.875932  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Tyr-3  tRNA-Tyr  100 
 
 		 81 bp  161  3e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0637  tRNA-Tyr  100 
 
 		 81 bp  161  3e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000000210414  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Tyr-1  tRNA-Tyr  98.7 
 
 		 81 bp  145  2e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000135792  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2567  tRNA-Tyr  100 
 
 		 81 bp  131  3e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0090  tRNA-Tyr  100 
 
 		 81 bp  131  3e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0608  tRNA-Tyr  95.16 
 
 		 84 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000101667  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Tyr-1  tRNA-Tyr  95.16 
 
 		 84 bp  99.6  9e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Tyr-2  tRNA-Tyr  95.16 
 
 		 84 bp  99.6  9e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0779  tRNA-Tyr  95.16 
 
 		 84 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.74653e-30 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0854  tRNA-Tyr  95.16 
 
 		 84 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000540408  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0082  tRNA-Tyr  95.16 
 
 		 84 bp  99.6  9e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000708983  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5651  tRNA-Tyr  95.16 
 
 		 84 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000725819  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5679  tRNA-Tyr  95.16 
 
 		 84 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000538647  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5688  tRNA-Tyr  95.16 
 
 		 84 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000511712  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Tyr-1  tRNA-Tyr  95.16 
 
 		 87 bp  99.6  9e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000180977  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Tyr-2  tRNA-Tyr  95.16 
 
 		 87 bp  99.6  9e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000316602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Tyr-1  tRNA-Tyr  95.16 
 
 		 87 bp  99.6  9e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0154705  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Tyr-2  tRNA-Tyr  95.16 
 
 		 87 bp  99.6  9e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000292226  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Tyr-3  tRNA-Tyr  95.16 
 
 		 87 bp  99.6  9e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000395282  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Tyr-1  tRNA-Tyr  95.16 
 
 		 87 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000397446  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Tyr-2  tRNA-Tyr  95.16 
 
 		 87 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00144807  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Tyr-3  tRNA-Tyr  95.16 
 
 		 87 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000630573  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0086  tRNA-Tyr  95.16 
 
 		 84 bp  99.6  9e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00209074  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0192  tRNA-Tyr  95.16 
 
 		 84 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000718643  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5726  tRNA-Tyr  95.16 
 
 		 84 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000809965  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4577  tRNA-Tyr  95.16 
 
 		 84 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000592849  normal  0.083174 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5714  tRNA-Tyr  95.16 
 
 		 84 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000564406  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0094  tRNA-Tyr  95.16 
 
 		 84 bp  99.6  9e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000196241  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0533  tRNA-Tyr  95.16 
 
 		 84 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.30142e-31 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Tyr-1  tRNA-Tyr  95.16 
 
 		 84 bp  99.6  9e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117276  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Tyr-2  tRNA-Tyr  95.16 
 
 		 84 bp  99.6  9e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000017627  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0037  tRNA-Tyr  95.16 
 
 		 84 bp  99.6  9e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000436078  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0098  tRNA-Tyr  95.16 
 
 		 84 bp  99.6  9e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157171  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0075  tRNA-Tyr  95.16 
 
 		 84 bp  99.6  9e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5654  tRNA-Tyr  95.16 
 
 		 84 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000770795  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0044  tRNA-Tyr  95.16 
 
 		 81 bp  99.6  9e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0171  tRNA-Tyr  95.16 
 
 		 84 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0235528 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5144  tRNA-Tyr  95.16 
 
 		 84 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000379395  normal  0.810906 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4769  tRNA-Tyr  95.16 
 
 		 84 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000283777  hitchhiker  6.00721e-16 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0044  tRNA-Tyr  95.16 
 
 		 82 bp  99.6  9e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0075  tRNA-Tyr  95.16 
 
 		 84 bp  99.6  9e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0037  tRNA-Tyr  93.55 
 
 		 84 bp  91.7  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.274575  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0100  tRNA-Tyr  93.75 
 
 		 82 bp  87.7  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0046  tRNA-Tyr  93.75 
 
 		 85 bp  87.7  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0037  tRNA-Tyr  92.19 
 
 		 85 bp  79.8  0.00000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.216376  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0109  tRNA-Tyr  92.19 
 
 		 82 bp  79.8  0.00000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.22534  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0235  tRNA-Tyr  90.74 
 
 		 83 bp  67.9  0.0000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00420239  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t1925  tRNA-Tyr  90.74 
 
 		 83 bp  67.9  0.0000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00221935  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0072  tRNA-Tyr  90.74 
 
 		 83 bp  67.9  0.0000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0015  tRNA-Tyr  90.2 
 
 		 83 bp  61.9  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000359756  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1539  tRNA-Tyr  87.5 
 
 		 82 bp  56  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1595  tRNA-Tyr  87.5 
 
 		 82 bp  56  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000957281  normal  0.565179 
 
 
-
 
NC_002950  PGt19  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  50.1  0.00008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00413231 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1846  tRNA-Tyr  91.89 
 
 		 83 bp  50.1  0.00008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0048  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  50.1  0.00008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0015  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00194399  normal  0.157065 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tSer01  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.454319  normal  0.359191 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0004  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 92 bp  48.1  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0046  tRNA-Ser  100 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna37  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 93 bp  46.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0034  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 93 bp  46.1  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.355586  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0030  tRNA-Tyr  88.37 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.881962  normal  0.97527 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0033  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 93 bp  46.1  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0032  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 93 bp  46.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0039  tRNA-Tyr  100 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000101038  hitchhiker  0.000000304321 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0045  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Ser-2  tRNA-Ser  100 
 
 		 94 bp  44.1  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAt11  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.644598  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt013  tRNA-Tyr  100 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0080367  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA_tRNA-Ser-1  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt13  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt18  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0053  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000572043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0057  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  44.1  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.328322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0023  tRNA-Ser  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0022  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  44.1  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0035  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  44.1  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135088  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0405  tRNA-Tyr  100 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.283193  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2014  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0295784  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0002  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0003  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0657  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  44.1  0.005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.96086  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0003  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0016  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0020  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  44.1  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000000716898  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0009  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.4364  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0036  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 91 bp  44.1  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0688413  normal  0.378449 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0088  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 91 bp  44.1  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0015  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.109725  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0061  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.318482  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0911  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.531015  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0004  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNASerVIMSS1309106  tRNA-Ser  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNASerVIMSS1309122  tRNA-Ser  100 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNASerVIMSS1309205  tRNA-Ser  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.98258  normal  0.324955 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1078  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0381421  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2051  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.244521  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNASerVIMSS1309165  tRNA-Ser  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0004  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  44.1  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000327404  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>