298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_R0008 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_R0008  tRNA-Ser  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0909337  hitchhiker  0.00840657 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0059  tRNA-Ser  87.36 
 
 		 90 bp  85.7  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0026  tRNA-Ser  87.36 
 
 		 90 bp  85.7  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23198  normal  0.0533139 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0027  tRNA-Ser  87.36 
 
 		 90 bp  85.7  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0061  tRNA-Ser  85.06 
 
 		 90 bp  69.9  0.00000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.388434  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0040  tRNA-Ser  85.06 
 
 		 90 bp  69.9  0.00000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.66072  hitchhiker  0.00010969 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0004  tRNA-Ser  85.06 
 
 		 90 bp  69.9  0.00000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0037  tRNA-Ser  85.54 
 
 		 90 bp  69.9  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.624734  normal  0.0421417 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0030  tRNA-Ser  85.54 
 
 		 90 bp  69.9  0.00000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.849468  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0022  tRNA-Ser  93.48 
 
 		 90 bp  67.9  0.0000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000743808  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0029  tRNA-Ser  93.48 
 
 		 90 bp  67.9  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0060  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 90 bp  65.9  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.100748  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0020  tRNA-Ser  86.3 
 
 		 90 bp  65.9  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0294133 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0815  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 90 bp  65.9  0.000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0378889  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0034  tRNA-Ser  93.18 
 
 		 88 bp  63.9  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000648564  hitchhiker  0.0000599111 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0033  tRNA-Ser  95 
 
 		 91 bp  63.9  0.000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000323834  hitchhiker  0.00000000664377 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0032  tRNA-Ser  95 
 
 		 91 bp  63.9  0.000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000241794  hitchhiker  0.000000080319 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0040  tRNA-Ser  95 
 
 		 88 bp  63.9  0.000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000505544  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0024  tRNA-Ser  86.11 
 
 		 90 bp  63.9  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.771773  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00023  tRNA-Ser  94.87 
 
 		 88 bp  61.9  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.115823  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0052  tRNA-Ser  94.87 
 
 		 88 bp  61.9  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000218477  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4663  tRNA-Ser  94.87 
 
 		 90 bp  61.9  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000383735  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1162  tRNA-Ser  94.87 
 
 		 90 bp  61.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.520358 
 
 
-
 
NC_004310  BR_t35  tRNA-Ser  83.91 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0004  tRNA-Ser  83.91 
 
 		 90 bp  61.9  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0024  tRNA-Ser  83.91 
 
 		 90 bp  61.9  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000000192923  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5026  tRNA-Ser  94.87 
 
 		 88 bp  61.9  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000747875  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0006  tRNA-Ser  83.91 
 
 		 90 bp  61.9  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0906398  normal  0.0288361 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0004  tRNA-Ser  83.91 
 
 		 90 bp  61.9  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2775  tRNA-Ser  94.87 
 
 		 90 bp  61.9  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0559618  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1128  tRNA-Ser  94.87 
 
 		 90 bp  61.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  8.93394e-25 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0065  tRNA-Ser  94.87 
 
 		 88 bp  61.9  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0269499  hitchhiker  0.0000672663 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1045  tRNA-Ser  94.87 
 
 		 90 bp  61.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.395551  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0042  tRNA-Ser  94.87 
 
 		 88 bp  61.9  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.760649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1206  tRNA-Ser  94.87 
 
 		 90 bp  61.9  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0041  tRNA-Ser  94.87 
 
 		 88 bp  61.9  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.985035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2147  tRNA-Ser  94.87 
 
 		 90 bp  61.9  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0226086  normal  0.478396 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1783  tRNA-Ser  83.91 
 
 		 92 bp  61.9  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.762858  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1150  tRNA-Ser  94.87 
 
 		 90 bp  61.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.14508  normal  0.321314 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1195  tRNA-Ser  94.87 
 
 		 90 bp  61.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t031  tRNA-Ser  90 
 
 		 91 bp  60  0.00000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t032  tRNA-Ser  90 
 
 		 91 bp  60  0.00000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t044  tRNA-Ser  90 
 
 		 91 bp  60  0.00000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0041  tRNA-Ser  90 
 
 		 91 bp  60  0.00000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00826938  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0040  tRNA-Ser  90 
 
 		 91 bp  60  0.00000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0094275  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0082  tRNA-Ser  90 
 
 		 91 bp  60  0.00000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00228786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0048  tRNA-Ser  90 
 
 		 91 bp  60  0.00000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000148304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0080  tRNA-Ser  90 
 
 		 91 bp  60  0.00000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000427026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0081  tRNA-Ser  90 
 
 		 91 bp  60  0.00000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000367206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0091  tRNA-Ser  90 
 
 		 91 bp  60  0.00000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00307776  normal  0.28235 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0072  tRNA-Ser  90 
 
 		 91 bp  60  0.00000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000100373  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0080  tRNA-Ser  90 
 
 		 91 bp  60  0.00000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000011536  normal  0.292608 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0081  tRNA-Ser  90 
 
 		 91 bp  60  0.00000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000139666  normal  0.289592 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0099  tRNA-Ser  90 
 
 		 91 bp  60  0.00000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.70942  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0140  tRNA-Ser  90 
 
 		 91 bp  60  0.00000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0059  tRNA-Ser  90 
 
 		 91 bp  60  0.00000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000260642  normal  0.0200922 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0049  tRNA-Ser  90 
 
 		 91 bp  60  0.00000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000491375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0060  tRNA-Ser  90 
 
 		 91 bp  60  0.00000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0136432  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0033  tRNA-Ser  90 
 
 		 91 bp  60  0.00000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.210279  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0034  tRNA-Ser  90 
 
 		 91 bp  60  0.00000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.014999  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0077  tRNA-Ser  90 
 
 		 91 bp  60  0.00000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000000799433  normal  0.199277 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0078  tRNA-Ser  90 
 
 		 91 bp  60  0.00000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000000673855  normal  0.197197 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0088  tRNA-Ser  90 
 
 		 91 bp  60  0.00000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00139579  hitchhiker  0.0000269185 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0062  tRNA-Ser  90 
 
 		 91 bp  60  0.00000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000500445  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0059  tRNA-Ser  90 
 
 		 91 bp  60  0.00000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000119289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0060  tRNA-Ser  90 
 
 		 91 bp  60  0.00000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000594401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0080  tRNA-Ser  90 
 
 		 91 bp  60  0.00000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.247761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0072  tRNA-Ser  90 
 
 		 91 bp  60  0.00000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0140823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0071  tRNA-Ser  90 
 
 		 91 bp  60  0.00000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000718864  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0070  tRNA-Ser  90 
 
 		 91 bp  60  0.00000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000322089  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0062  tRNA-Ser  90 
 
 		 91 bp  60  0.00000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00255663  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0081  tRNA-Ser  90 
 
 		 91 bp  60  0.00000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.147278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0061  tRNA-Ser  90 
 
 		 91 bp  60  0.00000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00295875  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0044  tRNA-Ser  90 
 
 		 91 bp  60  0.00000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00391672  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0060  tRNA-Ser  90 
 
 		 91 bp  60  0.00000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0407433  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAt03  tRNA-Ser  92.68 
 
 		 90 bp  58  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.038347  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0043  tRNA-Ser  91.11 
 
 		 88 bp  58  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0042  tRNA-Ser  94.59 
 
 		 91 bp  58  0.0000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000190684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0058  tRNA-Ser  91.11 
 
 		 88 bp  58  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.345279  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0005  tRNA-Ser  91.11 
 
 		 90 bp  58  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.507885  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0043  tRNA-Ser  92.68 
 
 		 90 bp  58  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t061  tRNA-Ser  89.8 
 
 		 91 bp  58  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.011458  hitchhiker  0.000000339916 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t070  tRNA-Ser  89.8 
 
 		 91 bp  58  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0130156  normal  0.270394 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0049  tRNA-Ser  91.11 
 
 		 88 bp  58  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t059  tRNA-Ser  89.8 
 
 		 91 bp  58  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000191448  hitchhiker  0.0000692537 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t060  tRNA-Ser  89.8 
 
 		 91 bp  58  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00263589  hitchhiker  0.000000337052 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0044  tRNA-Ser  94.59 
 
 		 91 bp  58  0.0000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.11052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0526  tRNA-Ser  92.68 
 
 		 92 bp  58  0.0000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0038  tRNA-Ser  91.11 
 
 		 88 bp  58  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.64209  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0056  tRNA-Ser  91.11 
 
 		 88 bp  58  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000159077  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0047  tRNA-Ser  91.11 
 
 		 88 bp  58  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.047697  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Ser-3  tRNA-Ser  92.5 
 
 		 88 bp  56  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.813738  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00325  tRNA-Ser  92.5 
 
 		 88 bp  56  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_rna009  tRNA-Ser  92.5 
 
 		 91 bp  56  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06826  tRNA-Ser  92.5 
 
 		 88 bp  56  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna117  tRNA-Ser  92.5 
 
 		 91 bp  56  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05459  tRNA-Ser  92.5 
 
 		 88 bp  56  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_rna016  tRNA-Ser  92.5 
 
 		 91 bp  56  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000103361  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03029  tRNA-Ser  92.5 
 
 		 88 bp  56  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0018  tRNA-Ser  90.91 
 
 		 90 bp  56  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>