More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MARTH_orf329 on replicon NC_011025
Organism: Mycoplasma arthritidis 158L3-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011025  MARTH_orf329  tyrosyl tRNA synthetase  100 
 
 
411 aa  827    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.708576  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0132  tyrosyl-tRNA synthetase  45.61 
 
 
415 aa  358  9.999999999999999e-98  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0639  tyrosyl-tRNA synthetase  41.97 
 
 
414 aa  326  4.0000000000000003e-88  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.529761  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3297  tyrosyl-tRNA synthetase  38.71 
 
 
433 aa  305  7e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2725  tyrosyl-tRNA synthetase  38.85 
 
 
419 aa  298  1e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000458338  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0714  tyrosyl-tRNA synthetase  38.13 
 
 
419 aa  297  3e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1536  tyrosyl-tRNA synthetase  38.97 
 
 
427 aa  294  2e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.280779  normal  0.602418 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1631  tyrosyl-tRNA synthetase  38.89 
 
 
431 aa  292  7e-78  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0158  tyrosyl-tRNA synthetase  39.86 
 
 
419 aa  291  1e-77  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0103805  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1507  tyrosyl-tRNA synthetase  38.84 
 
 
427 aa  290  3e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0498725  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0263  tyrosyl-tRNA synthetase  37.73 
 
 
430 aa  290  4e-77  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01620  tyrosyl-tRNA synthetase  37.93 
 
 
431 aa  290  4e-77  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.721032  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2044  tyrosyl-tRNA synthetase  39.66 
 
 
415 aa  289  5.0000000000000004e-77  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0431  tyrosyl-tRNA synthetase  38.1 
 
 
419 aa  288  1e-76  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0825328  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0550  tyrosyl-tRNA synthetase  37.5 
 
 
431 aa  288  2e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0587  hypothetical protein  37.65 
 
 
427 aa  286  4e-76  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1102  tyrosyl-tRNA synthetase  36.74 
 
 
433 aa  286  5.999999999999999e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000172362  normal  0.328183 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1847  tyrosyl-tRNA synthetase  39.37 
 
 
418 aa  285  9e-76  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.032326  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5211  tyrosyl-tRNA synthetase  36.78 
 
 
419 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4777  tyrosyl-tRNA synthetase  36.78 
 
 
419 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4797  tyrosyl-tRNA synthetase  36.78 
 
 
419 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1815  tyrosyl-tRNA synthetase  38.01 
 
 
417 aa  284  2.0000000000000002e-75  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4936  tyrosyl-tRNA synthetase  36.78 
 
 
419 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3333  tyrosyl-tRNA synthetase  38.37 
 
 
418 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5228  tyrosyl-tRNA synthetase  36.78 
 
 
419 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5314  tyrosyl-tRNA synthetase  36.78 
 
 
419 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5179  tyrosyl-tRNA synthetase  36.78 
 
 
419 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.731963 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4898  tyrosyl-tRNA synthetase  36.78 
 
 
420 aa  283  5.000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4488  tyrosyl-tRNA synthetase  37.74 
 
 
418 aa  282  7.000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4770  tyrosyl-tRNA synthetase  37.98 
 
 
418 aa  282  8.000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.110576  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0466  tyrosyl-tRNA synthetase  37.98 
 
 
418 aa  282  8.000000000000001e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000461262  hitchhiker  0.000000000000286759 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3316  tyrosyl-tRNA synthetase  37.38 
 
 
428 aa  282  8.000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.355813 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1293  tyrosyl-tRNA synthetase  39.57 
 
 
421 aa  282  9e-75  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4796  tyrosyl-tRNA synthetase  37.74 
 
 
418 aa  281  1e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.152048  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4556  tyrosyl-tRNA synthetase  37.74 
 
 
418 aa  281  2e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4391  tyrosyl-tRNA synthetase  37.74 
 
 
418 aa  281  2e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.692977  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl587  tyrosyl-tRNA synthetase  41.03 
 
 
413 aa  281  2e-74  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000761752  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4407  tyrosyl-tRNA synthetase  37.74 
 
 
418 aa  281  2e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4911  tyrosyl-tRNA synthetase  37.74 
 
 
418 aa  281  2e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.025731  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4776  tyrosyl-tRNA synthetase  37.74 
 
 
418 aa  281  2e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4793  tyrosyl-tRNA synthetase  37.74 
 
 
418 aa  281  2e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00466157  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1819  tyrosyl-tRNA synthetase  38.57 
 
 
420 aa  280  3e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1784  tyrosyl-tRNA synthetase  38.57 
 
 
420 aa  280  3e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5215  tyrosyl-tRNA synthetase  36.78 
 
 
420 aa  280  3e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236736  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0033  tyrosyl-tRNA synthetase  36.78 
 
 
420 aa  278  1e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0005431 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2160  tyrosyl-tRNA synthetase  35.75 
 
 
425 aa  276  6e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000761331  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0113  tyrosyl-tRNA synthetase  35.39 
 
 
432 aa  274  2.0000000000000002e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.397659  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0148  tyrosyl-tRNA synthetase  38.11 
 
 
416 aa  270  2e-71  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000162194  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01607  tyrosyl-tRNA synthetase  36.51 
 
 
424 aa  268  1e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01597  hypothetical protein  36.51 
 
 
424 aa  268  1e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2003  tyrosyl-tRNA synthetase  36.51 
 
 
424 aa  268  2e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00229572  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1713  tyrosyl-tRNA synthetase  36.51 
 
 
424 aa  268  2e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.205571  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1562  tyrosyl-tRNA synthetase  36.51 
 
 
424 aa  268  2e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1847  tyrosyl-tRNA synthetase  36.51 
 
 
424 aa  268  2e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000014829  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1829  tyrosyl-tRNA synthetase  36.51 
 
 
424 aa  268  2e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1992  tyrosyl-tRNA synthetase  36.51 
 
 
424 aa  268  2e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.013475 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2349  tyrosyl-tRNA synthetase  36.51 
 
 
424 aa  268  2e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0752557  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0177  tyrosyl-tRNA synthetase  36.21 
 
 
426 aa  266  5e-70  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000101088 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2069  tyrosyl-tRNA synthetase  35.46 
 
 
424 aa  265  1e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.309186  normal  0.0187777 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0237  tyrosyl-tRNA synthetase  35.25 
 
 
420 aa  264  2e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000657814  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3175  tyrosyl-tRNA synthetase  36.78 
 
 
424 aa  264  2e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0885439  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2362  tyrosyl-tRNA synthetase  35.63 
 
 
422 aa  263  3e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.587755  decreased coverage  0.00168263 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1619  tyrosyl-tRNA synthetase  35.83 
 
 
424 aa  263  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.321984  normal  0.630181 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1546  tyrosyl-tRNA synthetase  35.83 
 
 
424 aa  263  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.146335  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1559  tyrosyl-tRNA synthetase  35.83 
 
 
424 aa  263  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.363334 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1725  tyrosyl-tRNA synthetase  35.83 
 
 
424 aa  263  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00254392  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1894  tyrosyl-tRNA synthetase  35.83 
 
 
424 aa  263  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1811  tyrosyl-tRNA synthetase  35.76 
 
 
424 aa  263  6e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00221389  decreased coverage  0.000321192 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0802  tyrosyl-tRNA synthetase  36.24 
 
 
440 aa  262  6.999999999999999e-69  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.036725  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0676  tyrosine--tRNA ligase  36.24 
 
 
439 aa  262  6.999999999999999e-69  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2661  tyrosyl-tRNA synthetase  35.14 
 
 
425 aa  262  8.999999999999999e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.847771  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2554  tyrosyl-tRNA synthetase  35.55 
 
 
424 aa  262  1e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.268251  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000651  tyrosyl-tRNA synthetase  35.48 
 
 
419 aa  260  3e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1773  tyrosyl-tRNA synthetase  35.31 
 
 
424 aa  260  4e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1792  tyrosyl-tRNA synthetase  35.46 
 
 
424 aa  259  4e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.787858  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1881  tyrosyl-tRNA synthetase  35.31 
 
 
424 aa  260  4e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2377  tyrosyl-tRNA synthetase  34.59 
 
 
425 aa  259  8e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.898787  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2219  tyrosyl-tRNA synthetase  35.14 
 
 
424 aa  256  5e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000697542 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2021  tyrosyl-tRNA synthetase  35.73 
 
 
421 aa  255  8e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.146083 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6068  Tyrosine--tRNA ligase  34.54 
 
 
422 aa  255  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.581017  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1694  tyrosyl-tRNA synthetase  35.21 
 
 
424 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.239881  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1727  tyrosyl-tRNA synthetase  35.45 
 
 
424 aa  253  3e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11705  tyrosyl-tRNA synthetase  35.55 
 
 
424 aa  254  3e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.316613 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2683  tyrosyl-tRNA synthetase  34.89 
 
 
425 aa  253  5.000000000000001e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3294  tyrosyl-tRNA synthetase  35.24 
 
 
424 aa  252  7e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.354636  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1564  tyrosyl-tRNA synthetase  33.73 
 
 
425 aa  251  1e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06520  tyrosyl-tRNA synthetase  34.53 
 
 
418 aa  250  2e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1652  tyrosyl-tRNA synthetase  34.92 
 
 
427 aa  250  4e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1336  tyrosyl-tRNA synthetase  36.19 
 
 
419 aa  249  8e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.556286  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0332  tyrosyl-tRNA synthetase  34.47 
 
 
412 aa  249  9e-65  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.5093  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2831  tyrosyl-tRNA synthetase  34.76 
 
 
437 aa  248  9e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.121658  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1171  tyrosyl-tRNA synthetase  34.61 
 
 
420 aa  249  9e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.757017  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1100  tyrosyl-tRNA synthetase  34.61 
 
 
420 aa  248  1e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21660  tyrosyl-tRNA synthetase  33.41 
 
 
422 aa  248  1e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0207964  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25540  tyrosyl-tRNA synthetase  34.82 
 
 
424 aa  248  1e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0855  tyrosyl-tRNA synthetase  34.27 
 
 
426 aa  247  2e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00588538  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5445  tyrosyl-tRNA synthetase  34.82 
 
 
427 aa  248  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1044  tyrosyl-tRNA synthetase  34.61 
 
 
420 aa  245  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03200  tyrosine-tRNA ligase, putative  33.26 
 
 
478 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2338  tyrosyl-tRNA synthetase  36.69 
 
 
406 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000770628  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>