88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0964 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0964  hypothetical protein  100 
 
 		 89 aa  176  1e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0267  hypothetical protein  44.12 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3142  protein of unknown function DUF454  43.64 
 
 		 125 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0034209  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2522  hypothetical protein  40.68 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00419  conserved inner membrane protein  43.64 
 
 		 125 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0145391  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0545  hypothetical protein  43.64 
 
 		 125 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0504  hypothetical protein  43.64 
 
 		 125 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0827221  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3148  hypothetical protein  43.64 
 
 		 125 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.102596  normal  0.239123 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0511  hypothetical protein  43.64 
 
 		 125 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000222622  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00424  hypothetical protein  43.64 
 
 		 125 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0180358  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0948  hypothetical protein  41.82 
 
 		 125 aa  54.7  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.368818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0532  hypothetical protein  34.62 
 
 		 125 aa  54.7  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0586  hypothetical protein  34.62 
 
 		 125 aa  54.7  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.301005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0542  hypothetical protein  34.62 
 
 		 125 aa  54.7  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0526  hypothetical protein  34.62 
 
 		 125 aa  54.7  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0795  hypothetical protein  38.71 
 
 		 120 aa  54.7  0.0000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1045  hypothetical protein  31.82 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000150316  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0221  hypothetical protein  43.14 
 
 		 150 aa  53.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3807  hypothetical protein  43.64 
 
 		 121 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253442  hitchhiker  0.00000298507 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3459  protein of unknown function DUF454 transmembrane  44.9 
 
 		 117 aa  52.4  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0157  hypothetical protein  32.91 
 
 		 127 aa  52  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0558  hypothetical protein  41.82 
 
 		 125 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.13567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1113  hypothetical protein  36.14 
 
 		 82 aa  52.8  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0152  hypothetical protein  32.91 
 
 		 127 aa  52  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3740  hypothetical protein  45.83 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.468258  normal  0.0114181 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4024  hypothetical protein  43.64 
 
 		 121 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0163458 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4518  hypothetical protein  43.64 
 
 		 121 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.359562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2610  hypothetical protein  47.17 
 
 		 142 aa  51.6  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.287981 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1308  hypothetical protein  35.44 
 
 		 123 aa  51.6  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.060954  normal  0.0507678 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2850  protein of unknown function DUF454  41.51 
 
 		 142 aa  51.2  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000168142  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1466  hypothetical protein  40.68 
 
 		 131 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.387365 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2134  hypothetical protein  40 
 
 		 140 aa  50.8  0.000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.352277  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0722  hypothetical protein  36.71 
 
 		 122 aa  50.8  0.000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0981  protein of unknown function DUF454  38.16 
 
 		 125 aa  50.4  0.000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.208554  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2409  hypothetical protein  42.31 
 
 		 121 aa  50.4  0.000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000218775  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3890  hypothetical protein  45.65 
 
 		 135 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.482598  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1226  hypothetical protein  37.04 
 
 		 117 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1363  protein of unknown function DUF454  43.4 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000761785 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2886  hypothetical protein  37.04 
 
 		 117 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2662  hypothetical protein  38.89 
 
 		 117 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.111296  normal  0.437661 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2579  hypothetical protein  43.75 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45850  hypothetical protein  45.65 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1393  hypothetical protein  42.59 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3917  hypothetical protein  36.36 
 
 		 120 aa  48.5  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0768247  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3232  hypothetical protein  40.35 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.34095  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1847  hypothetical protein  41.27 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.331022  normal  0.61235 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0557  protein of unknown function DUF454  42.55 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0642321  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3478  protein of unknown function DUF454  36.36 
 
 		 140 aa  47.8  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.545002 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2011  hypothetical protein  36.21 
 
 		 122 aa  47.8  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0553  protein of unknown function DUF454  42.55 
 
 		 152 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2306  protein of unknown function DUF454  34.52 
 
 		 137 aa  47.4  0.00006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000646681  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0526  hypothetical protein  34.85 
 
 		 107 aa  47.8  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.63722  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4416  hypothetical protein  38.46 
 
 		 159 aa  47.8  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.799687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0524  hypothetical protein  42.55 
 
 		 155 aa  47.8  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.286047  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2502  hypothetical protein  47.62 
 
 		 152 aa  47  0.00008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3311  protein of unknown function DUF454  40.35 
 
 		 155 aa  46.2  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.639511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2936  protein of unknown function DUF454  37.04 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.252831  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0014  hypothetical protein  37.25 
 
 		 117 aa  46.2  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1791  hypothetical protein  41.38 
 
 		 122 aa  46.6  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.379134  hitchhiker  0.00000106844 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2688  hypothetical protein  33.33 
 
 		 123 aa  46.6  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2854  hypothetical protein  30.86 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.44368  hitchhiker  0.000000266441 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1701  hypothetical protein  41.18 
 
 		 181 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0681358  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0917  hypothetical protein  39.62 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.140199  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1810  hypothetical protein  41.82 
 
 		 132 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2172  hypothetical protein  38.33 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1642  hypothetical protein  38.89 
 
 		 133 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.96968  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3103  hypothetical protein  41.51 
 
 		 137 aa  45.1  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.362417  normal  0.26222 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0750  hypothetical protein  37.5 
 
 		 158 aa  44.3  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0570  hypothetical protein  44.19 
 
 		 132 aa  42.7  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000137123  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0848  hypothetical protein  38.89 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.225476 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03399  hypothetical protein  43.59 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1723  hypothetical protein  37.25 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.822691  normal  0.436905 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1355  hypothetical protein  39.13 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1115  hypothetical protein  32.79 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.242011 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1454  hypothetical protein  33.33 
 
 		 165 aa  42.4  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0600527 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1558  protein of unknown function DUF454  47.37 
 
 		 139 aa  42  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2576  hypothetical protein  31.75 
 
 		 122 aa  41.6  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000163875  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1767  protein of unknown function DUF454  31.75 
 
 		 122 aa  41.6  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000313735  hitchhiker  0.0045444 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1520  hypothetical protein  42 
 
 		 143 aa  41.2  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.757291  normal  0.895355 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1165  hypothetical protein  40.43 
 
 		 116 aa  41.2  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0333  hypothetical protein  36.36 
 
 		 133 aa  41.2  0.005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1924  hypothetical protein  26.58 
 
 		 147 aa  40.8  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1925  hypothetical protein  35.29 
 
 		 132 aa  40.4  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.946334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03089  hypothetical protein  50 
 
 		 115 aa  40.4  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2296  hypothetical protein  28.95 
 
 		 139 aa  40.4  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.656544  normal  0.0252392 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04126  hypothetical protein  35.29 
 
 		 174 aa  40.4  0.009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2237  hypothetical protein  44.12 
 
 		 122 aa  40  0.01  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000431925  hitchhiker  0.000763101 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2617  hypothetical protein  41.67 
 
 		 122 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000233192  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>