34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3426 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3426  general secretion pathway protein N  100 
 
 		 319 aa  599  1e-170  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000290078 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3135  general secretion pathway protein N  55.89 
 
 		 250 aa  252  5.000000000000001e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0138407 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0668  putative general secretory pathway N transmembrane protein  48.91 
 
 		 270 aa  216  5e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.267495 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0647  putative general secretory pathway N transmembrane protein  48.54 
 
 		 270 aa  215  7e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0363595  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0541  putative general secretory pathway N transmembrane protein  52.02 
 
 		 280 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3528  putative general secretory pathway N transmembrane protein  48.7 
 
 		 267 aa  214  9.999999999999999e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231863  normal  0.956925 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0918  type II secretion system protein N  47.96 
 
 		 282 aa  213  4.9999999999999996e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.339079  normal  0.312737 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0757  putative general secretory pathway N transmembrane protein  43.93 
 
 		 267 aa  192  5e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.142264 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1328  putative general secretory pathway N transmembrane protein  50.19 
 
 		 240 aa  185  7e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5696  putative general secretory pathway N transmembrane protein  43.88 
 
 		 267 aa  181  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.86222  normal  0.0481685 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1074  putative general secretory pathway N transmembrane protein  44.48 
 
 		 266 aa  171  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3051  general secretory pathway N transmembrane protein  34.36 
 
 		 280 aa  112  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.51549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3228  general secretory pathway N transmembrane protein  36.23 
 
 		 268 aa  108  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.114308  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3113  general secretory pathway N transmembrane protein  38.62 
 
 		 283 aa  107  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3398  putative general secretory pathway N transmembrane protein  34.31 
 
 		 280 aa  103  5e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3081  type II secretion system protein N  34.45 
 
 		 259 aa  101  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.173881  hitchhiker  0.000000265494 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3391  type II secretion system protein N  33.21 
 
 		 268 aa  101  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0018  general secretory pathway protein N  35.22 
 
 		 263 aa  101  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0041  hypothetical protein  35.32 
 
 		 262 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0052  hypothetical protein  35.91 
 
 		 262 aa  100  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.923907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0070  hypothetical protein  35.63 
 
 		 262 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.726501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0051  hypothetical protein  35.59 
 
 		 262 aa  99  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.356869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2673  general secretory pathway protein N  35.08 
 
 		 263 aa  97.8  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333526  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1879  general secretory pathway protein N  35.08 
 
 		 263 aa  97.8  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.174297  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3507  general secretory pathway protein N  35.08 
 
 		 263 aa  97.8  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.855134  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0019  hypothetical protein  35.63 
 
 		 274 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0328068  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2774  general secretory pathway protein N  35.08 
 
 		 263 aa  97.8  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0051  hypothetical protein  35.63 
 
 		 274 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0453147  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0019  general secretory pathway protein N  35.08 
 
 		 263 aa  97.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.470521  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0019  general secretory pathway protein N  35.08 
 
 		 263 aa  97.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0275939  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0231  general secretory pathway protein N  35.08 
 
 		 263 aa  97.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3233  hypothetical protein  34.82 
 
 		 274 aa  93.6  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0830722  normal  0.701162 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4490  putative general secretory pathway protein N  31.12 
 
 		 259 aa  90.5  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.252228  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3947  putative general secretory pathway protein N  31 
 
 		 259 aa  90.5  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.506993  normal  0.535358 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>