34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0757 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0757  putative general secretory pathway N transmembrane protein  100 
 
 		 267 aa  515  1.0000000000000001e-145  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.142264 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3528  putative general secretory pathway N transmembrane protein  58.21 
 
 		 267 aa  291  1e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231863  normal  0.956925 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0541  putative general secretory pathway N transmembrane protein  64.53 
 
 		 280 aa  285  4e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0647  putative general secretory pathway N transmembrane protein  60.78 
 
 		 270 aa  281  7.000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0363595  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0668  putative general secretory pathway N transmembrane protein  60.39 
 
 		 270 aa  278  9e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.267495 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0918  type II secretion system protein N  59.2 
 
 		 282 aa  276  2e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.339079  normal  0.312737 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5696  putative general secretory pathway N transmembrane protein  50.56 
 
 		 267 aa  233  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.86222  normal  0.0481685 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1074  putative general secretory pathway N transmembrane protein  51.31 
 
 		 266 aa  218  6e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1328  putative general secretory pathway N transmembrane protein  54.13 
 
 		 240 aa  206  3e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3426  general secretion pathway protein N  43.93 
 
 		 319 aa  171  1e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000290078 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3135  general secretion pathway protein N  48.71 
 
 		 250 aa  168  8e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0138407 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3113  general secretory pathway N transmembrane protein  38.46 
 
 		 283 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0041  hypothetical protein  39.22 
 
 		 262 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0051  hypothetical protein  39.22 
 
 		 262 aa  119  6e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.356869  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3051  general secretory pathway N transmembrane protein  35.55 
 
 		 280 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.51549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3507  general secretory pathway protein N  36.17 
 
 		 263 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.855134  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2774  general secretory pathway protein N  36.17 
 
 		 263 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2673  general secretory pathway protein N  36.17 
 
 		 263 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333526  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1879  general secretory pathway protein N  36.17 
 
 		 263 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.174297  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0018  general secretory pathway protein N  37.02 
 
 		 263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0019  general secretory pathway protein N  36.17 
 
 		 263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.470521  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0019  general secretory pathway protein N  36.17 
 
 		 263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0275939  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0231  general secretory pathway protein N  36.17 
 
 		 263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0019  hypothetical protein  37.93 
 
 		 274 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0328068  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0070  hypothetical protein  37.93 
 
 		 262 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.726501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0051  hypothetical protein  37.93 
 
 		 274 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0453147  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0052  hypothetical protein  38.79 
 
 		 262 aa  112  9e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.923907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3233  hypothetical protein  38.36 
 
 		 274 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0830722  normal  0.701162 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3228  general secretory pathway N transmembrane protein  35.97 
 
 		 268 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.114308  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3391  type II secretion system protein N  32.11 
 
 		 268 aa  108  7.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3947  putative general secretory pathway protein N  34.91 
 
 		 259 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.506993  normal  0.535358 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3398  putative general secretory pathway N transmembrane protein  34.98 
 
 		 280 aa  106  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4490  putative general secretory pathway protein N  34.25 
 
 		 259 aa  104  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.252228  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3081  type II secretion system protein N  34.87 
 
 		 259 aa  102  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.173881  hitchhiker  0.000000265494 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>