34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3051 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_3051  general secretory pathway N transmembrane protein  100 
 
 		 280 aa  543  1e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.51549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3398  putative general secretory pathway N transmembrane protein  95.71 
 
 		 280 aa  502  1e-141  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3113  general secretory pathway N transmembrane protein  75.18 
 
 		 283 aa  375  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3228  general secretory pathway N transmembrane protein  55.81 
 
 		 268 aa  258  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.114308  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3391  type II secretion system protein N  51.15 
 
 		 268 aa  248  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3081  type II secretion system protein N  45.22 
 
 		 259 aa  167  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.173881  hitchhiker  0.000000265494 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0051  hypothetical protein  46.78 
 
 		 262 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.356869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0041  hypothetical protein  46.78 
 
 		 262 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0052  hypothetical protein  46.32 
 
 		 262 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.923907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0018  general secretory pathway protein N  44.84 
 
 		 263 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4490  putative general secretory pathway protein N  43.29 
 
 		 259 aa  160  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.252228  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2774  general secretory pathway protein N  44.84 
 
 		 263 aa  159  5e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2673  general secretory pathway protein N  44.84 
 
 		 263 aa  159  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333526  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0019  general secretory pathway protein N  44.84 
 
 		 263 aa  159  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0275939  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0019  general secretory pathway protein N  44.84 
 
 		 263 aa  159  5e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.470521  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1879  general secretory pathway protein N  44.84 
 
 		 263 aa  159  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.174297  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0231  general secretory pathway protein N  44.84 
 
 		 263 aa  159  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3507  general secretory pathway protein N  44.84 
 
 		 263 aa  159  5e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.855134  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0019  hypothetical protein  45.89 
 
 		 274 aa  159  5e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0328068  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0051  hypothetical protein  45.89 
 
 		 274 aa  159  5e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0453147  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0070  hypothetical protein  45.89 
 
 		 262 aa  158  8e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.726501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3233  hypothetical protein  45.89 
 
 		 274 aa  158  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0830722  normal  0.701162 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3947  putative general secretory pathway protein N  42.47 
 
 		 259 aa  154  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.506993  normal  0.535358 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5696  putative general secretory pathway N transmembrane protein  40.55 
 
 		 267 aa  132  6.999999999999999e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.86222  normal  0.0481685 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0918  type II secretion system protein N  39 
 
 		 282 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.339079  normal  0.312737 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0757  putative general secretory pathway N transmembrane protein  35.55 
 
 		 267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.142264 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0541  putative general secretory pathway N transmembrane protein  36.55 
 
 		 280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0647  putative general secretory pathway N transmembrane protein  36.68 
 
 		 270 aa  105  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0363595  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0668  putative general secretory pathway N transmembrane protein  36.68 
 
 		 270 aa  103  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.267495 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3528  putative general secretory pathway N transmembrane protein  34.21 
 
 		 267 aa  104  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231863  normal  0.956925 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3135  general secretion pathway protein N  39.04 
 
 		 250 aa  103  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0138407 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1074  putative general secretory pathway N transmembrane protein  35.32 
 
 		 266 aa  99.8  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1328  putative general secretory pathway N transmembrane protein  35.68 
 
 		 240 aa  97.1  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3426  general secretion pathway protein N  31.78 
 
 		 319 aa  94.7  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000290078 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>