34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A4490 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A4490  putative general secretory pathway protein N  100 
 
 		 259 aa  513  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.252228  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3947  putative general secretory pathway protein N  92.28 
 
 		 259 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.506993  normal  0.535358 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3081  type II secretion system protein N  75.29 
 
 		 259 aa  370  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.173881  hitchhiker  0.000000265494 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0018  general secretory pathway protein N  66.14 
 
 		 263 aa  318  5e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2774  general secretory pathway protein N  64.2 
 
 		 263 aa  315  5e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0019  general secretory pathway protein N  64.2 
 
 		 263 aa  315  5e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.470521  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1879  general secretory pathway protein N  64.2 
 
 		 263 aa  315  5e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.174297  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0019  general secretory pathway protein N  64.2 
 
 		 263 aa  315  5e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0275939  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2673  general secretory pathway protein N  64.2 
 
 		 263 aa  315  5e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333526  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3507  general secretory pathway protein N  64.2 
 
 		 263 aa  315  5e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.855134  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0231  general secretory pathway protein N  64.2 
 
 		 263 aa  315  5e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0052  hypothetical protein  63.81 
 
 		 262 aa  310  2e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.923907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0070  hypothetical protein  63.42 
 
 		 262 aa  305  7e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.726501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3233  hypothetical protein  64.43 
 
 		 274 aa  304  8.000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0830722  normal  0.701162 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0019  hypothetical protein  63.42 
 
 		 274 aa  304  9.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0328068  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0051  hypothetical protein  63.42 
 
 		 274 aa  304  9.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0453147  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0041  hypothetical protein  62.85 
 
 		 262 aa  297  9e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0051  hypothetical protein  62.45 
 
 		 262 aa  296  3e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.356869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3391  type II secretion system protein N  46.09 
 
 		 268 aa  204  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3228  general secretory pathway N transmembrane protein  47.66 
 
 		 268 aa  198  6e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.114308  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3051  general secretory pathway N transmembrane protein  44.21 
 
 		 280 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.51549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3398  putative general secretory pathway N transmembrane protein  43.39 
 
 		 280 aa  161  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3113  general secretory pathway N transmembrane protein  42.22 
 
 		 283 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5696  putative general secretory pathway N transmembrane protein  38.55 
 
 		 267 aa  135  6.0000000000000005e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.86222  normal  0.0481685 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3528  putative general secretory pathway N transmembrane protein  36.86 
 
 		 267 aa  122  4e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231863  normal  0.956925 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0918  type II secretion system protein N  36.67 
 
 		 282 aa  122  7e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.339079  normal  0.312737 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0647  putative general secretory pathway N transmembrane protein  35.34 
 
 		 270 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0363595  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1074  putative general secretory pathway N transmembrane protein  35.75 
 
 		 266 aa  118  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0757  putative general secretory pathway N transmembrane protein  34.25 
 
 		 267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.142264 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0668  putative general secretory pathway N transmembrane protein  34.35 
 
 		 270 aa  115  6e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.267495 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3135  general secretion pathway protein N  37.93 
 
 		 250 aa  110  3e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0138407 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1328  putative general secretory pathway N transmembrane protein  33.93 
 
 		 240 aa  103  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0541  putative general secretory pathway N transmembrane protein  33.77 
 
 		 280 aa  102  8e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3426  general secretion pathway protein N  30.48 
 
 		 319 aa  84.3  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000290078 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>