30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0930 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0930  transcriptional regulator  100 
 
 		 91 aa  183  5e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00205943  normal  0.115025 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0364  XRE family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 100 aa  52.4  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000740846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1165  toxin-antitoxin system, antitoxin component, Xre family  36.99 
 
 		 94 aa  51.6  0.000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000604987 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1031  transcriptional regulator, XRE family  34.57 
 
 		 89 aa  48.9  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000313321  normal  0.707924 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4384  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 108 aa  47.8  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1361  EPSP synthase (3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase)  42.55 
 
 		 516 aa  47.4  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.419571  normal  0.53858 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0763  XRE family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 91 aa  46.6  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3182  transcriptional regulator, XRE family  39.58 
 
 		 513 aa  47  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0470208  hitchhiker  0.000000000985397 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3260  transcriptional regulator, XRE family  42.37 
 
 		 513 aa  46.2  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0795644  normal  0.23679 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3103  transcriptional regulator, XRE family  34.55 
 
 		 503 aa  45.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.597911  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1361  transcriptional regulator, XRE family  32 
 
 		 93 aa  44.3  0.0007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2672  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  43.48 
 
 		 508 aa  43.9  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1888  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 136 aa  43.9  0.0009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0038  Helix-turn-helix domain protein  42.22 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000109438  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0889  putative transcriptional regulator, XRE family  30.56 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0650  XRE family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0791  transcriptional regulator, XRE family  24.44 
 
 		 91 aa  42.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3100  transcriptional regulator, XRE family  45.83 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000473627  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2176  transcriptional regulator, XRE family  57.14 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0074  hypothetical protein  36.23 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17690  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  34.69 
 
 		 517 aa  41.6  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.356525  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2878  transcriptional regulator, XRE family  37.04 
 
 		 235 aa  41.2  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4023  transcriptional regulator, XRE family  28.92 
 
 		 94 aa  40.8  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3620  transcriptional regulator, XRE family  27.78 
 
 		 99 aa  40.8  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.494695  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7086  transcriptional regulator, XRE family  26.39 
 
 		 119 aa  40.8  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.633613  normal  0.10188 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0928  DNA polymerase III delta prime subunit  36.84 
 
 		 90 aa  40.8  0.007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13300  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  38.89 
 
 		 509 aa  40.4  0.008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.801467  normal  0.209244 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5326  transcriptional regulator, XRE family  41.3 
 
 		 68 aa  40.4  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.134062 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01498  hypothetical protein  28.95 
 
 		 94 aa  40  0.01  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.573871  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01487  phage N15 gp48-like protein  28.95 
 
 		 94 aa  40  0.01  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.497667  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>