20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_07180 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_07180  hypothetical protein  100 
 
 
529 aa  994    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.685735  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36100  hypothetical protein  33.07 
 
 
528 aa  183  8.000000000000001e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0679941  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2591  hypothetical protein  35.05 
 
 
523 aa  182  1e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0833226  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0944  hypothetical protein  33.15 
 
 
532 aa  181  2.9999999999999997e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0975  hypothetical protein  33.21 
 
 
518 aa  158  2e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.16467  hitchhiker  0.00124053 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2750  putative integral membrane transport protein  34.46 
 
 
542 aa  137  3.0000000000000003e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23120  hypothetical protein  29.98 
 
 
570 aa  137  5e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.522082  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2323  hypothetical protein  31.98 
 
 
523 aa  132  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000190454 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08260  hypothetical protein  31.04 
 
 
533 aa  122  1.9999999999999998e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26400  hypothetical protein  30.12 
 
 
575 aa  110  7.000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.104566 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4501  hypothetical protein  31.03 
 
 
560 aa  101  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.610631  normal  0.263243 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1844  hypothetical protein  27.09 
 
 
557 aa  99.8  1e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5013  hypothetical protein  29.6 
 
 
559 aa  96.7  8e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000363082 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1322  hypothetical protein  31.33 
 
 
539 aa  96.7  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.322613  normal  0.449633 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1136  hypothetical protein  23.32 
 
 
550 aa  85.9  0.000000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3106  hypothetical protein  28.4 
 
 
534 aa  84  0.000000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000141938  hitchhiker  0.000284669 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3073  ABC transporter permease protein  30.25 
 
 
533 aa  79.3  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00508741  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2590  hypothetical protein  23.76 
 
 
618 aa  54.3  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.193504  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2693  hypothetical protein  30.23 
 
 
566 aa  49.7  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.806993  normal  0.190746 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1122  hypothetical protein  29.22 
 
 
553 aa  44.3  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.106292 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>