14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_1136 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_1136  hypothetical protein  100 
 
 		 550 aa  1092    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1844  hypothetical protein  34.52 
 
 		 557 aa  283  5.000000000000001e-75  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0944  hypothetical protein  25.73 
 
 		 532 aa  100  9e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36100  hypothetical protein  25.22 
 
 		 528 aa  99.8  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0679941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2591  hypothetical protein  26.07 
 
 		 523 aa  93.6  8e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0833226  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2750  putative integral membrane transport protein  25.41 
 
 		 542 aa  79  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2323  hypothetical protein  25.33 
 
 		 523 aa  77.8  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000190454 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0975  hypothetical protein  27.44 
 
 		 518 aa  77.4  0.0000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.16467  hitchhiker  0.00124053 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4501  hypothetical protein  23.66 
 
 		 560 aa  64.3  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.610631  normal  0.263243 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5013  hypothetical protein  24.17 
 
 		 559 aa  60.5  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000363082 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26400  hypothetical protein  27.75 
 
 		 575 aa  55.8  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.104566 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07180  hypothetical protein  23.49 
 
 		 529 aa  55.5  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.685735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3106  hypothetical protein  23.42 
 
 		 534 aa  54.7  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000141938  hitchhiker  0.000284669 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3073  ABC transporter permease protein  22.53 
 
 		 533 aa  52.8  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00508741  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>