19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_36100 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_36100  hypothetical protein  100 
 
 		 528 aa  993    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0679941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26400  hypothetical protein  47.78 
 
 		 575 aa  357  3.9999999999999996e-97  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.104566 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2591  hypothetical protein  42.21 
 
 		 523 aa  328  2.0000000000000001e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0833226  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0944  hypothetical protein  43.04 
 
 		 532 aa  325  1e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0975  hypothetical protein  46.49 
 
 		 518 aa  312  1e-83  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.16467  hitchhiker  0.00124053 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2323  hypothetical protein  45.35 
 
 		 523 aa  304  3.0000000000000004e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000190454 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2750  putative integral membrane transport protein  38.42 
 
 		 542 aa  226  1e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08260  hypothetical protein  33.82 
 
 		 533 aa  160  6e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1844  hypothetical protein  28.32 
 
 		 557 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07180  hypothetical protein  32.11 
 
 		 529 aa  152  1e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.685735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23120  hypothetical protein  28.15 
 
 		 570 aa  149  1.0000000000000001e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.522082  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4501  hypothetical protein  30.91 
 
 		 560 aa  140  6e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.610631  normal  0.263243 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1136  hypothetical protein  26.51 
 
 		 550 aa  118  1.9999999999999998e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5013  hypothetical protein  30.41 
 
 		 559 aa  113  9e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000363082 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3106  hypothetical protein  28.71 
 
 		 534 aa  98.6  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000141938  hitchhiker  0.000284669 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1322  hypothetical protein  31.51 
 
 		 539 aa  96.7  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.322613  normal  0.449633 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3073  ABC transporter permease protein  28.72 
 
 		 533 aa  79  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00508741  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2865  hypothetical protein  28.74 
 
 		 526 aa  48.1  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0216967  normal  0.115817 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2590  hypothetical protein  23.02 
 
 		 618 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.193504  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>