16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1844 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1844  hypothetical protein  100 
 
 
557 aa  1092    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1136  hypothetical protein  34.52 
 
 
550 aa  283  5.000000000000001e-75  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36100  hypothetical protein  28.27 
 
 
528 aa  134  5e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0679941  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0944  hypothetical protein  28.51 
 
 
532 aa  113  8.000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2750  putative integral membrane transport protein  26.72 
 
 
542 aa  100  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2591  hypothetical protein  27.61 
 
 
523 aa  91.3  4e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0833226  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2323  hypothetical protein  27.26 
 
 
523 aa  90.1  9e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000190454 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26400  hypothetical protein  26.87 
 
 
575 aa  83.6  0.000000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.104566 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4501  hypothetical protein  23.78 
 
 
560 aa  74.7  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.610631  normal  0.263243 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0975  hypothetical protein  28.31 
 
 
518 aa  72.8  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.16467  hitchhiker  0.00124053 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5013  hypothetical protein  24.39 
 
 
559 aa  69.3  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000363082 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07180  hypothetical protein  30.15 
 
 
529 aa  68.9  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.685735  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1322  hypothetical protein  25.9 
 
 
539 aa  60.5  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.322613  normal  0.449633 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08260  hypothetical protein  28.47 
 
 
533 aa  58.9  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23120  hypothetical protein  21.93 
 
 
570 aa  59.3  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.522082  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3106  hypothetical protein  25.31 
 
 
534 aa  53.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000141938  hitchhiker  0.000284669 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>