18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4501 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4501  hypothetical protein  100 
 
 		 560 aa  1047    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.610631  normal  0.263243 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5013  hypothetical protein  85.89 
 
 		 559 aa  826    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000363082 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23120  hypothetical protein  32.32 
 
 		 570 aa  152  2e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.522082  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2750  putative integral membrane transport protein  32.53 
 
 		 542 aa  142  9.999999999999999e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1322  hypothetical protein  32.79 
 
 		 539 aa  132  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.322613  normal  0.449633 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0944  hypothetical protein  28.88 
 
 		 532 aa  131  3e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2591  hypothetical protein  29.91 
 
 		 523 aa  127  6e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0833226  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36100  hypothetical protein  30.25 
 
 		 528 aa  123  9.999999999999999e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0679941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2323  hypothetical protein  28.71 
 
 		 523 aa  107  5e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000190454 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26400  hypothetical protein  31.58 
 
 		 575 aa  102  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.104566 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0975  hypothetical protein  29.8 
 
 		 518 aa  93.2  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.16467  hitchhiker  0.00124053 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07180  hypothetical protein  30.49 
 
 		 529 aa  89  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.685735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3106  hypothetical protein  27.49 
 
 		 534 aa  82  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000141938  hitchhiker  0.000284669 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1844  hypothetical protein  23.78 
 
 		 557 aa  75.9  0.000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2865  hypothetical protein  27.64 
 
 		 526 aa  68.9  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0216967  normal  0.115817 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1136  hypothetical protein  23.72 
 
 		 550 aa  66.2  0.000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3073  ABC transporter permease protein  28.14 
 
 		 533 aa  54.3  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00508741  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1122  hypothetical protein  28.14 
 
 		 553 aa  45.4  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.106292 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>