16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_26400 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_26400  hypothetical protein  100 
 
 
575 aa  1047    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.104566 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36100  hypothetical protein  47.91 
 
 
528 aa  367  1e-100  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0679941  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2591  hypothetical protein  40.73 
 
 
523 aa  293  4e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0833226  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0944  hypothetical protein  41.67 
 
 
532 aa  286  5e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0975  hypothetical protein  44.03 
 
 
518 aa  258  2e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.16467  hitchhiker  0.00124053 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2323  hypothetical protein  39.89 
 
 
523 aa  251  2e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000190454 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2750  putative integral membrane transport protein  35.26 
 
 
542 aa  193  9e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08260  hypothetical protein  35.96 
 
 
533 aa  154  2.9999999999999998e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4501  hypothetical protein  31.2 
 
 
560 aa  116  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.610631  normal  0.263243 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5013  hypothetical protein  30.62 
 
 
559 aa  111  5e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000363082 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1844  hypothetical protein  30.38 
 
 
557 aa  109  1e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23120  hypothetical protein  26.95 
 
 
570 aa  108  4e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.522082  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07180  hypothetical protein  30.09 
 
 
529 aa  100  5e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.685735  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1322  hypothetical protein  27.49 
 
 
539 aa  90.1  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.322613  normal  0.449633 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3106  hypothetical protein  29.11 
 
 
534 aa  79  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000141938  hitchhiker  0.000284669 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1136  hypothetical protein  23.94 
 
 
550 aa  77  0.0000000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>