15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3073 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_3073  ABC transporter permease protein  100 
 
 
533 aa  1026    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00508741  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2590  hypothetical protein  27.26 
 
 
618 aa  150  7e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.193504  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36100  hypothetical protein  28.75 
 
 
528 aa  77  0.0000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0679941  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1122  hypothetical protein  26.69 
 
 
553 aa  74.7  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.106292 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23120  hypothetical protein  27.4 
 
 
570 aa  73.9  0.000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.522082  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1322  hypothetical protein  28.13 
 
 
539 aa  65.1  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.322613  normal  0.449633 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5013  hypothetical protein  26.61 
 
 
559 aa  62.8  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000363082 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3106  hypothetical protein  25.92 
 
 
534 aa  62  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000141938  hitchhiker  0.000284669 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1136  hypothetical protein  23.39 
 
 
550 aa  60.8  0.00000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2865  hypothetical protein  26.48 
 
 
526 aa  60.1  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0216967  normal  0.115817 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4501  hypothetical protein  28.34 
 
 
560 aa  57.8  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.610631  normal  0.263243 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2591  hypothetical protein  28.19 
 
 
523 aa  51.2  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0833226  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2693  hypothetical protein  35.71 
 
 
566 aa  45.4  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.806993  normal  0.190746 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07180  hypothetical protein  28.64 
 
 
529 aa  45.4  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.685735  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2750  putative integral membrane transport protein  29.96 
 
 
542 aa  45.1  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>