36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0143 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0143  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  289  8e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3510  putative multidrug resistance protein  58.76 
 
 		 424 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1832  putative multidrug resistance protein  58.76 
 
 		 424 aa  114  5e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1687  major facilitator transporter  56.7 
 
 		 422 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1948  putative multidrug resistance protein  55.67 
 
 		 424 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.138123  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1913  major facilitator superfamily protein  55.67 
 
 		 409 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1671  tetracycline resistance protein  55.67 
 
 		 421 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.113591  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1869  putative multidrug resistance protein  55.67 
 
 		 421 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.94346e-22 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1647  multidrug ABC transporter permease  54.64 
 
 		 421 aa  105  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5926  major facilitator superfamily transporter  64.1 
 
 		 432 aa  103  6e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1689  metabolite transport protein, N-terminus  54.43 
 
 		 114 aa  93.6  8e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.164457  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14300  Major Facilitator Superfamily transporter  64.44 
 
 		 436 aa  80.9  0.000000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000199719  normal  0.135833 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2339  major facilitator transporter  41.25 
 
 		 421 aa  67.8  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1521  major facilitator superfamily MFS_1  41 
 
 		 433 aa  67  0.00000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.542357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4185  major facilitator superfamily MFS_1  40.66 
 
 		 420 aa  66.6  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.236137  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1690  metabolite transport protein, C-terminus  64 
 
 		 314 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0503244  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3922  major facilitator superfamily MFS_1  40.59 
 
 		 422 aa  62.8  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3779  major facilitator transporter  42.35 
 
 		 435 aa  58.5  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1580  major facilitator superfamily MFS_1  38.64 
 
 		 444 aa  58.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1416  major facilitator superfamily MFS_1  40.79 
 
 		 402 aa  56.6  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0501  major facilitator superfamily MFS_1  36.36 
 
 		 427 aa  53.5  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0602709  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1731  major facilitator superfamily MFS_1  39.02 
 
 		 444 aa  51.6  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.288133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6677  hypothetical protein  35.11 
 
 		 428 aa  51.2  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306335  normal  0.32672 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2322  major facilitator superfamily transporter  32.31 
 
 		 425 aa  51.2  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.798593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2171  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 427 aa  51.2  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00215555  hitchhiker  0.00378482 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1537  major facilitator superfamily MFS_1  33.85 
 
 		 401 aa  50.8  0.000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2887  major facilitator superfamily MFS_1  37.61 
 
 		 423 aa  49.7  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.208438  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4568  major facilitator transporter  37.35 
 
 		 401 aa  48.1  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.368636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1387  major facilitator transporter  44 
 
 		 448 aa  46.2  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0788229 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2369  major facilitator transporter  36.99 
 
 		 408 aa  44.3  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00076702  hitchhiker  0.0000240113 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1812  major facilitator superfamily MFS_1  37.35 
 
 		 441 aa  43.9  0.0009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000055329 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2250  major facilitator superfamily MFS_1  35.71 
 
 		 420 aa  43.5  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0910349 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0563  major facilitator superfamily MFS_1  32.94 
 
 		 426 aa  41.6  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.55774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1787  major facilitator superfamily MFS_1  46.15 
 
 		 420 aa  41.6  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.406772 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1156  major facilitator transporter  32 
 
 		 409 aa  42  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0229771 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1542  major facilitator transporter  43.94 
 
 		 395 aa  40.4  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.682888  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>