67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0852 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_0852  protoporphyrinogen oxidase  100 
 
 		 173 aa  350  5.9999999999999994e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0227417  normal  0.141132 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4324  protoporphyrinogen oxidase  29.78 
 
 		 190 aa  73.9  0.0000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1035  protoporphyrinogen oxidase  29.55 
 
 		 188 aa  71.2  0.000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.395736  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4255  flavodoxin/nitric oxide synthase  27.44 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4369  protoporphyrinogen oxidase  25.9 
 
 		 181 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000843735  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4131  Protoporphyrinogen oxidase  25.9 
 
 		 181 aa  59.3  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000348526  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03741  protoporphyrin oxidase, flavoprotein  25.9 
 
 		 181 aa  59.3  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00160389  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03690  hypothetical protein  25.9 
 
 		 181 aa  59.3  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000962205  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5289  protoporphyrinogen oxidase  25.9 
 
 		 181 aa  59.3  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000241436  normal  0.0811334 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4231  protoporphyrinogen oxidase  25.9 
 
 		 181 aa  58.9  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000133684  normal  0.0229749 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4160  protoporphyrinogen oxidase  25.9 
 
 		 181 aa  59.3  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000131743  decreased coverage  0.00000239257 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4073  protoporphyrinogen oxidase  25.9 
 
 		 181 aa  59.3  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000311087  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0198  protoporphyrinogen oxidase  28 
 
 		 173 aa  58.9  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3601  protoporphyrinogen oxidase  26.86 
 
 		 174 aa  58.2  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.934061  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4320  protoporphyrinogen oxidase  25.3 
 
 		 181 aa  57.8  0.00000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000364139  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3403  flavodoxin/nitric oxide synthase  27.93 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.200863  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3897  protoporphyrinogen oxidase  28.25 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0092686  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3743  protoporphyrinogen oxidase  27.27 
 
 		 179 aa  55.8  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000514113  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2953  protoporphyrinogen oxidase  24.38 
 
 		 175 aa  55.5  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.410486 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0027  protoporphyrinogen oxidase  20 
 
 		 175 aa  54.3  0.0000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00412155  normal  0.0535555 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4230  protoporphyrinogen oxidase  26.47 
 
 		 179 aa  53.9  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0023265  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3336  protoporphyrinogen oxidase  25.58 
 
 		 178 aa  53.9  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4040  protoporphyrinogen oxidase  26.47 
 
 		 179 aa  52.8  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00450028  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4373  protoporphyrinogen oxidase  24.71 
 
 		 181 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.0000903845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4217  protoporphyrinogen oxidase  24.71 
 
 		 181 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000339833  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4313  protoporphyrinogen oxidase  24.71 
 
 		 181 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000309624  normal  0.107941 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4266  protoporphyrinogen oxidase  24.71 
 
 		 181 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000166727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4194  protoporphyrinogen oxidase  24.55 
 
 		 181 aa  51.6  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00000219448  normal  0.630031 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0793  protoporphyrinogen oxidase  24.69 
 
 		 173 aa  51.6  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1487  protoporphyrinogen oxidase  15.95 
 
 		 175 aa  51.6  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.040472  hitchhiker  0.00766519 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0287  protoporphyrinogen oxidase  24.14 
 
 		 177 aa  49.7  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000232863  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0025  protoporphyrinogen oxidase  19.41 
 
 		 175 aa  50.1  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00857411 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3929  protoporphyrinogen oxidase  24.14 
 
 		 177 aa  49.7  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.00000000000339774  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1916  protoporphyrinogen oxidase  24.14 
 
 		 177 aa  49.7  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000017226  normal  0.191063 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0673  protoporphyrinogen oxidase  22.56 
 
 		 177 aa  50.1  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001985  protoporphyrinogen IX oxidase oxygen-independent HemG  25 
 
 		 175 aa  49.3  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000384734  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0022  protoporphyrinogen oxidase  20 
 
 		 175 aa  48.9  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3038  protoporphyrinogen oxidase  21.47 
 
 		 173 aa  48.9  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0023  protoporphyrinogen oxidase  18.24 
 
 		 175 aa  48.9  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000262535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3066  protoporphyrinogen oxidase  21.47 
 
 		 173 aa  48.9  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0377442 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0019  protoporphyrinogen oxidase  19.88 
 
 		 175 aa  48.5  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0020  protoporphyrinogen oxidase  19.88 
 
 		 174 aa  47.8  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000664462  normal  0.064653 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0022  protoporphyrinogen oxidase  19.88 
 
 		 174 aa  47.8  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000530188  hitchhiker  0.000763246 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0028  protoporphyrinogen oxidase  19.88 
 
 		 174 aa  47.8  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000780551  hitchhiker  0.000000145429 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09631  putative protoporphyrinogen oxidase  20.59 
 
 		 178 aa  48.1  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0906  protoporphyrinogen oxidase  20.86 
 
 		 173 aa  47.4  0.00009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0024  Protoporphyrinogen oxidase  18.9 
 
 		 174 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.776203  hitchhiker  0.00000179508 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00463  protoporphyrinogen oxidase  24.14 
 
 		 175 aa  47  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0025  flavodoxin  19.88 
 
 		 174 aa  47  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0020  protoporphyrinogen oxidase  18.9 
 
 		 174 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000993803  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0017  protoporphyrinogen oxidase  21.39 
 
 		 176 aa  46.2  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.229911  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0266  protoporphyrinogen oxidase  26.26 
 
 		 177 aa  46.6  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0106275  normal  0.013044 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0871  protoporphyrinogen oxidase  20.86 
 
 		 173 aa  45.8  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0025  protoporphyrinogen oxidase  18.9 
 
 		 174 aa  44.7  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0214113  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0024  protoporphyrinogen oxidase  18.9 
 
 		 174 aa  44.3  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0780321  normal  0.0115046 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0017  protoporphyrinogen oxidase  20.35 
 
 		 174 aa  44.3  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.324297  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0678  protoporphyrinogen oxidase  23.03 
 
 		 173 aa  43.5  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.103464 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2882  protoporphyrinogen oxidase  33.33 
 
 		 178 aa  43.9  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2977  protoporphyrinogen oxidase  25 
 
 		 174 aa  42.7  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0027  protoporphyrinogen oxidase  22.09 
 
 		 179 aa  43.1  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0184042 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0141  Protoporphyrinogen oxidase  20.37 
 
 		 173 aa  42.4  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3790  protoporphyrinogen oxidase  24.07 
 
 		 175 aa  42  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3945  protoporphyrinogen oxidase  23.16 
 
 		 180 aa  41.6  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000851494  decreased coverage  0.00158179 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0019  protoporphyrinogen oxidase  20.37 
 
 		 181 aa  41.2  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.827877  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0973  protoporphyrinogen oxidase  21.21 
 
 		 173 aa  41.2  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.705197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0036  protoporphyrinogen oxidase  22.09 
 
 		 177 aa  41.2  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.144256 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0019  protoporphyrinogen oxidase  22.75 
 
 		 184 aa  40.8  0.009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.309289  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>