20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1090 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_1090  hypothetical protein  100 
 
 
358 aa  709    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.464508  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0096  hypothetical protein  41.16 
 
 
368 aa  243  3e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1204  hypothetical protein  39.28 
 
 
374 aa  220  3.9999999999999997e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2158  hypothetical protein  32.03 
 
 
377 aa  178  1e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0819  hypothetical protein  27.74 
 
 
288 aa  102  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0952597  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0879  hypothetical protein  27.78 
 
 
282 aa  81.6  0.00000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00133282  hitchhiker  0.00000451683 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0684  hypothetical protein  28.18 
 
 
293 aa  80.1  0.00000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0665668  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0403  hypothetical protein  27.04 
 
 
302 aa  70.5  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0446468 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0191  hypothetical protein  21.99 
 
 
369 aa  70.1  0.00000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00000405856  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0599  hypothetical protein  19.4 
 
 
332 aa  66.6  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0640845  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0387  hypothetical protein  34.29 
 
 
298 aa  63.5  0.000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.780865  decreased coverage  0.000937212 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2400  hypothetical protein  27.6 
 
 
272 aa  56.6  0.0000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.689464  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1354  hypothetical protein  19.93 
 
 
332 aa  54.7  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.503856  hitchhiker  0.000000556659 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5569  hypothetical protein  32.35 
 
 
698 aa  51.6  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0409  hypothetical protein  20.33 
 
 
305 aa  49.7  0.00007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00000922496  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1429  hypothetical protein  24.9 
 
 
279 aa  49.7  0.00009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0126799  hitchhiker  0.00107655 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1322  hypothetical protein  20.54 
 
 
332 aa  48.5  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.142648  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1753  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility auxiliary component-like  25.31 
 
 
481 aa  47.8  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.424796  normal  0.0791157 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0025  phosphotransferase domain-containing protein  25.54 
 
 
742 aa  47  0.0005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.04569  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3291  hypothetical protein  29.03 
 
 
251 aa  44.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000286826  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>