18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0096 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0096  hypothetical protein  100 
 
 
368 aa  720    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1090  hypothetical protein  41.16 
 
 
358 aa  248  9e-65  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.464508  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1204  hypothetical protein  41.41 
 
 
374 aa  224  1e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2158  hypothetical protein  36.92 
 
 
377 aa  196  6e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0387  hypothetical protein  31.33 
 
 
298 aa  88.6  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.780865  decreased coverage  0.000937212 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0879  hypothetical protein  26.32 
 
 
282 aa  84  0.000000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00133282  hitchhiker  0.00000451683 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0819  hypothetical protein  27.04 
 
 
288 aa  82.4  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0952597  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0191  hypothetical protein  22.41 
 
 
369 aa  77  0.0000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00000405856  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0403  hypothetical protein  25.85 
 
 
302 aa  74.7  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0446468 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0684  hypothetical protein  28 
 
 
293 aa  74.3  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0665668  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2400  hypothetical protein  28.27 
 
 
272 aa  62.4  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.689464  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1354  hypothetical protein  19.94 
 
 
332 aa  62  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.503856  hitchhiker  0.000000556659 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0599  hypothetical protein  18.7 
 
 
332 aa  57.8  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0640845  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1429  hypothetical protein  25.2 
 
 
279 aa  57  0.0000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0126799  hitchhiker  0.00107655 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1322  hypothetical protein  22.33 
 
 
332 aa  53.1  0.000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.142648  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0409  hypothetical protein  20.3 
 
 
305 aa  49.7  0.00008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00000922496  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0208  hypothetical protein  24.06 
 
 
266 aa  48.5  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.0010863  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3291  hypothetical protein  25.77 
 
 
251 aa  43.1  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000286826  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>