14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1322 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1322  hypothetical protein  100 
 
 		 332 aa  662    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.142648  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1354  hypothetical protein  51.81 
 
 		 332 aa  333  3e-90  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.503856  hitchhiker  0.000000556659 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0599  hypothetical protein  49.7 
 
 		 332 aa  330  2e-89  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0640845  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0191  hypothetical protein  41.96 
 
 		 369 aa  276  4e-73  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00000405856  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0409  hypothetical protein  35.66 
 
 		 305 aa  144  2e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00000922496  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2400  hypothetical protein  25.38 
 
 		 272 aa  73.9  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.689464  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0819  hypothetical protein  28.02 
 
 		 288 aa  72  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0952597  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0403  hypothetical protein  25.56 
 
 		 302 aa  63.5  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0446468 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0684  hypothetical protein  24.08 
 
 		 293 aa  60.1  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0665668  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0879  hypothetical protein  28.86 
 
 		 282 aa  57.8  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00133282  hitchhiker  0.00000451683 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1204  hypothetical protein  20.95 
 
 		 374 aa  56.2  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1090  hypothetical protein  20.15 
 
 		 358 aa  48.1  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.464508  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0096  hypothetical protein  23.57 
 
 		 368 aa  46.2  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2511  hypothetical protein  25.4 
 
 		 387 aa  46.2  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>