14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2400 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_2400  hypothetical protein  100 
 
 		 272 aa  549  1e-155  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.689464  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0684  hypothetical protein  39.27 
 
 		 293 aa  163  3e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0665668  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0819  hypothetical protein  33.08 
 
 		 288 aa  152  5e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0952597  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0403  hypothetical protein  29.74 
 
 		 302 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0446468 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0879  hypothetical protein  39.38 
 
 		 282 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00133282  hitchhiker  0.00000451683 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0387  hypothetical protein  35.69 
 
 		 298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.780865  decreased coverage  0.000937212 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2158  hypothetical protein  27.48 
 
 		 377 aa  79.7  0.00000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1322  hypothetical protein  25.38 
 
 		 332 aa  74.3  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.142648  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0599  hypothetical protein  22.34 
 
 		 332 aa  62.4  0.000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0640845  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1204  hypothetical protein  27.24 
 
 		 374 aa  62  0.000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0096  hypothetical protein  28.76 
 
 		 368 aa  59.7  0.00000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0409  hypothetical protein  22.07 
 
 		 305 aa  58.9  0.00000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00000922496  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1354  hypothetical protein  23.89 
 
 		 332 aa  58.5  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.503856  hitchhiker  0.000000556659 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1090  hypothetical protein  27.51 
 
 		 358 aa  58.5  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.464508  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>