18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0819 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0819  hypothetical protein  100 
 
 
288 aa  585  1e-166  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0952597  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0403  hypothetical protein  37.94 
 
 
302 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0446468 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0684  hypothetical protein  39.43 
 
 
293 aa  185  7e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0665668  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2400  hypothetical protein  33.08 
 
 
272 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.689464  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0387  hypothetical protein  38.1 
 
 
298 aa  150  2e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.780865  decreased coverage  0.000937212 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0879  hypothetical protein  35.5 
 
 
282 aa  124  2e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00133282  hitchhiker  0.00000451683 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1090  hypothetical protein  27.74 
 
 
358 aa  102  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.464508  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0599  hypothetical protein  26.55 
 
 
332 aa  85.9  7e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0640845  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0191  hypothetical protein  23.93 
 
 
369 aa  80.1  0.00000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00000405856  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0409  hypothetical protein  27.66 
 
 
305 aa  79.3  0.00000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00000922496  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1354  hypothetical protein  27.12 
 
 
332 aa  78.2  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.503856  hitchhiker  0.000000556659 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0096  hypothetical protein  27.04 
 
 
368 aa  74.3  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1322  hypothetical protein  28.02 
 
 
332 aa  72.4  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.142648  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2158  hypothetical protein  22.26 
 
 
377 aa  70.5  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1204  hypothetical protein  27.27 
 
 
374 aa  68.9  0.00000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0208  hypothetical protein  26.87 
 
 
266 aa  53.9  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.0010863  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1429  hypothetical protein  22.6 
 
 
279 aa  49.7  0.00006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0126799  hitchhiker  0.00107655 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0244  hypothetical protein  26.45 
 
 
254 aa  42.7  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000208552  hitchhiker  0.000000653556 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>