18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0684 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0684  hypothetical protein  100 
 
 
293 aa  590  1e-167  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0665668  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0819  hypothetical protein  35.54 
 
 
288 aa  192  4e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0952597  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0403  hypothetical protein  35.48 
 
 
302 aa  188  7e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0446468 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2400  hypothetical protein  39.18 
 
 
272 aa  170  2e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.689464  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0387  hypothetical protein  40.22 
 
 
298 aa  167  2e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.780865  decreased coverage  0.000937212 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0879  hypothetical protein  37.5 
 
 
282 aa  145  1e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00133282  hitchhiker  0.00000451683 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1090  hypothetical protein  27.24 
 
 
358 aa  89  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.464508  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0599  hypothetical protein  23.91 
 
 
332 aa  73.2  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0640845  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2158  hypothetical protein  24.91 
 
 
377 aa  70.5  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0096  hypothetical protein  28 
 
 
368 aa  68.2  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1354  hypothetical protein  22.61 
 
 
332 aa  62  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.503856  hitchhiker  0.000000556659 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1204  hypothetical protein  25.76 
 
 
374 aa  60.8  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1322  hypothetical protein  23.26 
 
 
332 aa  60.1  0.00000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.142648  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0409  hypothetical protein  26.43 
 
 
305 aa  58.5  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00000922496  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0191  hypothetical protein  20.66 
 
 
369 aa  54.7  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00000405856  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1429  hypothetical protein  23.71 
 
 
279 aa  50.8  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0126799  hitchhiker  0.00107655 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0208  hypothetical protein  35.14 
 
 
266 aa  50.1  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.0010863  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0244  hypothetical protein  27.74 
 
 
254 aa  43.9  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000208552  hitchhiker  0.000000653556 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>