18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1204 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_1204  hypothetical protein  100 
 
 
374 aa  736    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0096  hypothetical protein  41.41 
 
 
368 aa  241  1e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1090  hypothetical protein  39.71 
 
 
358 aa  236  3e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.464508  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2158  hypothetical protein  38.03 
 
 
377 aa  213  2.9999999999999995e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0819  hypothetical protein  27.27 
 
 
288 aa  90.1  6e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0952597  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0403  hypothetical protein  24.32 
 
 
302 aa  89  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0446468 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2400  hypothetical protein  27.57 
 
 
272 aa  76.3  0.0000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.689464  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0879  hypothetical protein  28.57 
 
 
282 aa  75.9  0.000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00133282  hitchhiker  0.00000451683 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0684  hypothetical protein  25.73 
 
 
293 aa  75.1  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0665668  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0599  hypothetical protein  20.79 
 
 
332 aa  70.5  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0640845  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1354  hypothetical protein  20.26 
 
 
332 aa  66.6  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.503856  hitchhiker  0.000000556659 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1429  hypothetical protein  26.67 
 
 
279 aa  65.5  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0126799  hitchhiker  0.00107655 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0387  hypothetical protein  27.86 
 
 
298 aa  57.8  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.780865  decreased coverage  0.000937212 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0244  hypothetical protein  26.21 
 
 
254 aa  57  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000208552  hitchhiker  0.000000653556 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1322  hypothetical protein  21.81 
 
 
332 aa  55.8  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.142648  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0208  hypothetical protein  26.55 
 
 
266 aa  53.5  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.0010863  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0191  hypothetical protein  18.61 
 
 
369 aa  52.4  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00000405856  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0409  hypothetical protein  18.88 
 
 
305 aa  43.9  0.005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00000922496  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>