15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_1354 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_1354  hypothetical protein  100 
 
 
332 aa  653    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.503856  hitchhiker  0.000000556659 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0599  hypothetical protein  82.53 
 
 
332 aa  550  1e-156  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0640845  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0191  hypothetical protein  48.78 
 
 
369 aa  320  3e-86  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00000405856  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1322  hypothetical protein  51.81 
 
 
332 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.142648  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0409  hypothetical protein  36.89 
 
 
305 aa  186  7e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00000922496  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0819  hypothetical protein  27.12 
 
 
288 aa  78.2  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0952597  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0879  hypothetical protein  27.35 
 
 
282 aa  70.1  0.00000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00133282  hitchhiker  0.00000451683 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1204  hypothetical protein  20.26 
 
 
374 aa  65.1  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0403  hypothetical protein  25.52 
 
 
302 aa  61.2  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0446468 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2400  hypothetical protein  23.99 
 
 
272 aa  57.8  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.689464  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0684  hypothetical protein  24.12 
 
 
293 aa  57.4  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0665668  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1090  hypothetical protein  19.93 
 
 
358 aa  54.7  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.464508  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0096  hypothetical protein  19.94 
 
 
368 aa  54.7  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2158  hypothetical protein  25.66 
 
 
377 aa  52  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0387  hypothetical protein  29.89 
 
 
298 aa  45.1  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.780865  decreased coverage  0.000937212 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>