38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5609 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5609  selenium-binding protein  100 
 
 		 607 aa  1246    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.134626 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1311  selenium-binding protein  35.48 
 
 		 448 aa  232  2e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3647  selenium-binding protein  33.56 
 
 		 466 aa  198  3e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0967  selenium-binding protein  33.56 
 
 		 462 aa  188  2e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0835459  normal  0.405151 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4229  selenium-binding protein  31.94 
 
 		 462 aa  186  8e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0336  selenium-binding protein  30.62 
 
 		 463 aa  177  4e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0498  selenium-binding protein  31.94 
 
 		 469 aa  174  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0509  selenium-binding protein  31.94 
 
 		 469 aa  174  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0487  selenium-binding protein  31.94 
 
 		 469 aa  174  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.961794  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0663  selenium-binding protein  30.65 
 
 		 466 aa  172  2e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.151689  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5039  56kDa selenium binding  31.29 
 
 		 464 aa  171  5e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4189  selenium-binding protein  30.5 
 
 		 464 aa  169  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2982  selenium-binding protein  30.77 
 
 		 465 aa  168  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000704485  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0524  selenium-binding protein  33.33 
 
 		 461 aa  169  2e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.377432 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0757  selenium-binding protein  31.07 
 
 		 466 aa  168  2.9999999999999998e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.264464  normal  0.367666 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1019  selenium-binding protein  31.5 
 
 		 462 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.240439  normal  0.354487 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2492  selenium-binding protein  31.95 
 
 		 468 aa  163  8.000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.710896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2621  selenium-binding protein  31.95 
 
 		 468 aa  163  9e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0724  selenium-binding protein  32.41 
 
 		 468 aa  163  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2597  selenium-binding protein  31.49 
 
 		 468 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1962  selenium-binding protein  31.49 
 
 		 468 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.84799  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2573  selenium-binding protein  31.49 
 
 		 468 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5904  56kDa selenium binding protein  31.95 
 
 		 468 aa  161  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.54154 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2173  putative redox protein, selenium binding  30.57 
 
 		 468 aa  158  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0088  putative selenium binding protein  30.48 
 
 		 468 aa  155  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.135423  normal  0.395764 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5378  selenium-binding protein  31.32 
 
 		 574 aa  153  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2095  selenium-binding protein  29.43 
 
 		 468 aa  153  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2869  selenium-binding protein  29.09 
 
 		 463 aa  151  3e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.74609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7220  selenium-binding protein  29.66 
 
 		 461 aa  148  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.332846 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2414  selenium-binding protein  29.47 
 
 		 468 aa  144  4e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000733012  decreased coverage  0.00141792 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1126  selenium-binding protein, putative  30.4 
 
 		 440 aa  130  8.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.789868  normal  0.636279 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1226  selenium-binding protein, putative  31.07 
 
 		 440 aa  123  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.331845  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0317  selenium-binding protein, putative  27.25 
 
 		 459 aa  117  6.9999999999999995e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.940405  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03562  conserved hypothetical protein  24.24 
 
 		 465 aa  55.5  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.565558 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1481  hypothetical protein  21.18 
 
 		 396 aa  53.1  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.363757  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6217  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  27.86 
 
 		 829 aa  44.3  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.597655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4743  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  35.16 
 
 		 457 aa  44.3  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1746  3-carboxymuconate cyclase-like protein  31.76 
 
 		 328 aa  43.9  0.01  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00917254  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>