22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1481 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1481  hypothetical protein  100 
 
 		 396 aa  820    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.363757  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5609  selenium-binding protein  21.18 
 
 		 607 aa  53.1  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.134626 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3620  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.29 
 
 		 324 aa  53.1  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.793181  normal  0.0342651 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1117  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  21.57 
 
 		 331 aa  52.8  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1180  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.44 
 
 		 348 aa  50.8  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3230  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.81 
 
 		 517 aa  50.8  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.476229  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  21.14 
 
 		 1667 aa  49.7  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.33 
 
 		 340 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.802386 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0029  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.33 
 
 		 340 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0028  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.33 
 
 		 340 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.828005  decreased coverage  0.000046618 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5392  YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  25.33 
 
 		 377 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0101451 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1302  hypothetical protein  25 
 
 		 364 aa  47.8  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.127226  normal  0.259109 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.86 
 
 		 752 aa  47  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481443  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1651  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  23.36 
 
 		 366 aa  45.8  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0495995  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03562  conserved hypothetical protein  22.86 
 
 		 465 aa  45.8  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.565558 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4548  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  21.78 
 
 		 347 aa  44.7  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1435  hypothetical protein  20.81 
 
 		 335 aa  43.9  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.61404 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  19.37 
 
 		 689 aa  43.5  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4199  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  21.81 
 
 		 316 aa  43.9  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13098  normal  0.347847 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1536  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.55 
 
 		 362 aa  43.5  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1335  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.55 
 
 		 324 aa  43.1  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.911892  normal  0.360031 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0269  phosphoribosylaminoimidazole carboxylase, catalytic subunit  34.41 
 
 		 157 aa  43.1  0.009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.020501  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>