33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1019 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1019  selenium-binding protein  100 
 
 		 462 aa  940    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.240439  normal  0.354487 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2982  selenium-binding protein  82.15 
 
 		 465 aa  794    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000704485  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5378  selenium-binding protein  67.87 
 
 		 574 aa  643    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0336  selenium-binding protein  65.45 
 
 		 463 aa  635    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5039  56kDa selenium binding  64.59 
 
 		 464 aa  632  1e-180  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0498  selenium-binding protein  67.1 
 
 		 469 aa  627  1e-178  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0509  selenium-binding protein  67.1 
 
 		 469 aa  627  1e-178  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0487  selenium-binding protein  67.1 
 
 		 469 aa  627  1e-178  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.961794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2869  selenium-binding protein  63.38 
 
 		 463 aa  610  1e-173  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.74609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4189  selenium-binding protein  61.37 
 
 		 464 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7220  selenium-binding protein  63.54 
 
 		 461 aa  601  1.0000000000000001e-171  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.332846 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2414  selenium-binding protein  66.59 
 
 		 468 aa  603  1.0000000000000001e-171  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000733012  decreased coverage  0.00141792 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1962  selenium-binding protein  59.1 
 
 		 468 aa  548  1e-155  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.84799  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2573  selenium-binding protein  59.1 
 
 		 468 aa  548  1e-155  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2597  selenium-binding protein  59.1 
 
 		 468 aa  548  1e-155  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0967  selenium-binding protein  57.11 
 
 		 462 aa  545  1e-154  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0835459  normal  0.405151 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0663  selenium-binding protein  58.71 
 
 		 466 aa  542  1e-153  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.151689  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0724  selenium-binding protein  58.67 
 
 		 468 aa  542  1e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5904  56kDa selenium binding protein  58.71 
 
 		 468 aa  544  1e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.54154 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2621  selenium-binding protein  58.28 
 
 		 468 aa  537  1e-151  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2492  selenium-binding protein  58.28 
 
 		 468 aa  537  1e-151  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.710896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2095  selenium-binding protein  56.77 
 
 		 468 aa  536  1e-151  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2173  putative redox protein, selenium binding  56.56 
 
 		 468 aa  534  1e-150  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0088  putative selenium binding protein  56.56 
 
 		 468 aa  525  1e-148  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.135423  normal  0.395764 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0757  selenium-binding protein  53.21 
 
 		 466 aa  500  1e-140  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.264464  normal  0.367666 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0524  selenium-binding protein  54.8 
 
 		 461 aa  493  9.999999999999999e-139  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.377432 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1311  selenium-binding protein  42.32 
 
 		 448 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4229  selenium-binding protein  41.99 
 
 		 462 aa  308  1.0000000000000001e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3647  selenium-binding protein  40.82 
 
 		 466 aa  285  1.0000000000000001e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5609  selenium-binding protein  31.5 
 
 		 607 aa  164  3e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.134626 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0317  selenium-binding protein, putative  27.65 
 
 		 459 aa  111  3e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.940405  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1226  selenium-binding protein, putative  27.25 
 
 		 440 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.331845  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1126  selenium-binding protein, putative  26.65 
 
 		 440 aa  99  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.789868  normal  0.636279 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>