33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0088 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0757  selenium-binding protein  75.59 
 
 		 466 aa  736    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.264464  normal  0.367666 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0724  selenium-binding protein  86.08 
 
 		 468 aa  857    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5904  56kDa selenium binding protein  85.62 
 
 		 468 aa  853    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.54154 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2173  putative redox protein, selenium binding  93.59 
 
 		 468 aa  921    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0088  putative selenium binding protein  100 
 
 		 468 aa  969    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.135423  normal  0.395764 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1962  selenium-binding protein  87.12 
 
 		 468 aa  866    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.84799  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2597  selenium-binding protein  87.12 
 
 		 468 aa  866    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2492  selenium-binding protein  86.91 
 
 		 468 aa  862    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.710896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2621  selenium-binding protein  86.7 
 
 		 468 aa  861    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2573  selenium-binding protein  87.12 
 
 		 468 aa  866    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2095  selenium-binding protein  92.31 
 
 		 468 aa  909    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0336  selenium-binding protein  59.31 
 
 		 463 aa  579  1e-164  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4189  selenium-binding protein  56.16 
 
 		 464 aa  555  1e-157  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2982  selenium-binding protein  57.2 
 
 		 465 aa  553  1e-156  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000704485  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5039  56kDa selenium binding  55.72 
 
 		 464 aa  545  1e-154  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2869  selenium-binding protein  56.8 
 
 		 463 aa  539  9.999999999999999e-153  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.74609  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1019  selenium-binding protein  56.77 
 
 		 462 aa  535  1e-151  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.240439  normal  0.354487 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0967  selenium-binding protein  54.43 
 
 		 462 aa  519  1e-146  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0835459  normal  0.405151 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0663  selenium-binding protein  55.82 
 
 		 466 aa  512  1e-144  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.151689  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0487  selenium-binding protein  54.06 
 
 		 469 aa  509  1e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.961794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0509  selenium-binding protein  54.06 
 
 		 469 aa  509  1e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0498  selenium-binding protein  54.06 
 
 		 469 aa  509  1e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0524  selenium-binding protein  54.74 
 
 		 461 aa  502  1e-141  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.377432 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7220  selenium-binding protein  54.72 
 
 		 461 aa  502  1e-141  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.332846 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5378  selenium-binding protein  53.94 
 
 		 574 aa  501  1e-140  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2414  selenium-binding protein  54 
 
 		 468 aa  481  1e-134  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000733012  decreased coverage  0.00141792 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1311  selenium-binding protein  43.52 
 
 		 448 aa  383  1e-105  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4229  selenium-binding protein  40.91 
 
 		 462 aa  323  5e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3647  selenium-binding protein  39.52 
 
 		 466 aa  310  4e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5609  selenium-binding protein  30.48 
 
 		 607 aa  160  7e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.134626 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1226  selenium-binding protein, putative  26.81 
 
 		 440 aa  99.8  9e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.331845  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1126  selenium-binding protein, putative  26.92 
 
 		 440 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.789868  normal  0.636279 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0317  selenium-binding protein, putative  26.42 
 
 		 459 aa  96.7  8e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.940405  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>