33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_2597 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_0757  selenium-binding protein  76.23 
 
 
466 aa  743    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.264464  normal  0.367666 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0724  selenium-binding protein  94.23 
 
 
468 aa  915    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5904  56kDa selenium binding protein  96.79 
 
 
468 aa  941    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.54154 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2173  putative redox protein, selenium binding  86.27 
 
 
468 aa  858    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0088  putative selenium binding protein  87.12 
 
 
468 aa  847    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.135423  normal  0.395764 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1962  selenium-binding protein  100 
 
 
468 aa  967    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.84799  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2597  selenium-binding protein  100 
 
 
468 aa  967    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2492  selenium-binding protein  97.65 
 
 
468 aa  946    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.710896  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2621  selenium-binding protein  97.44 
 
 
468 aa  945    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2573  selenium-binding protein  100 
 
 
468 aa  967    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2095  selenium-binding protein  86.48 
 
 
468 aa  863    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0336  selenium-binding protein  60.99 
 
 
463 aa  597  1e-169  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4189  selenium-binding protein  58.96 
 
 
464 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2982  selenium-binding protein  59.87 
 
 
465 aa  571  1e-161  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000704485  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5039  56kDa selenium binding  57.45 
 
 
464 aa  561  1e-158  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2869  selenium-binding protein  58.32 
 
 
463 aa  557  1e-157  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.74609  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1019  selenium-binding protein  59.1 
 
 
462 aa  548  1e-155  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.240439  normal  0.354487 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0967  selenium-binding protein  56.37 
 
 
462 aa  530  1e-149  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0835459  normal  0.405151 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0487  selenium-binding protein  56.13 
 
 
469 aa  521  1e-146  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.961794  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0509  selenium-binding protein  56.13 
 
 
469 aa  521  1e-146  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0498  selenium-binding protein  56.13 
 
 
469 aa  521  1e-146  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0663  selenium-binding protein  55.17 
 
 
466 aa  521  1e-146  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.151689  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7220  selenium-binding protein  56.65 
 
 
461 aa  517  1.0000000000000001e-145  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.332846 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0524  selenium-binding protein  55.6 
 
 
461 aa  514  1e-144  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.377432 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5378  selenium-binding protein  54.89 
 
 
574 aa  506  9.999999999999999e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2414  selenium-binding protein  54.58 
 
 
468 aa  486  1e-136  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000733012  decreased coverage  0.00141792 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1311  selenium-binding protein  45.18 
 
 
448 aa  385  1e-106  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4229  selenium-binding protein  41.9 
 
 
462 aa  328  1.0000000000000001e-88  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3647  selenium-binding protein  42.55 
 
 
466 aa  322  9.999999999999999e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5609  selenium-binding protein  31.49 
 
 
607 aa  162  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.134626 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1126  selenium-binding protein, putative  26.94 
 
 
440 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.789868  normal  0.636279 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0317  selenium-binding protein, putative  27.49 
 
 
459 aa  94.7  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.940405  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1226  selenium-binding protein, putative  27.16 
 
 
440 aa  92  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.331845  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>