33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5378 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1019  selenium-binding protein  68.45 
 
 		 462 aa  643    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.240439  normal  0.354487 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2982  selenium-binding protein  72.34 
 
 		 465 aa  694    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000704485  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2414  selenium-binding protein  71.55 
 
 		 468 aa  641    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000733012  decreased coverage  0.00141792 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5378  selenium-binding protein  100 
 
 		 574 aa  1156    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0487  selenium-binding protein  69.89 
 
 		 469 aa  660    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.961794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0509  selenium-binding protein  69.89 
 
 		 469 aa  660    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0498  selenium-binding protein  69.89 
 
 		 469 aa  660    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0336  selenium-binding protein  61.06 
 
 		 463 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4189  selenium-binding protein  59.66 
 
 		 464 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5039  56kDa selenium binding  59.79 
 
 		 464 aa  565  1e-160  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2869  selenium-binding protein  58.17 
 
 		 463 aa  535  1e-151  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.74609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7220  selenium-binding protein  58.44 
 
 		 461 aa  528  1e-148  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.332846 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0724  selenium-binding protein  55.77 
 
 		 468 aa  513  1e-144  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2573  selenium-binding protein  54.89 
 
 		 468 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0967  selenium-binding protein  53 
 
 		 462 aa  508  9.999999999999999e-143  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0835459  normal  0.405151 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1962  selenium-binding protein  54.89 
 
 		 468 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.84799  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2597  selenium-binding protein  54.89 
 
 		 468 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5904  56kDa selenium binding protein  54.8 
 
 		 468 aa  502  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.54154 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2621  selenium-binding protein  54.26 
 
 		 468 aa  499  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2173  putative redox protein, selenium binding  53.73 
 
 		 468 aa  499  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2492  selenium-binding protein  54.47 
 
 		 468 aa  501  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.710896  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0663  selenium-binding protein  54.19 
 
 		 466 aa  495  1e-139  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.151689  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2095  selenium-binding protein  52.67 
 
 		 468 aa  488  1e-136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0088  putative selenium binding protein  53.3 
 
 		 468 aa  487  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.135423  normal  0.395764 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0524  selenium-binding protein  53.08 
 
 		 461 aa  479  1e-134  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.377432 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0757  selenium-binding protein  49.79 
 
 		 466 aa  466  9.999999999999999e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.264464  normal  0.367666 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1311  selenium-binding protein  40.96 
 
 		 448 aa  363  3e-99  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4229  selenium-binding protein  39.34 
 
 		 462 aa  293  5e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3647  selenium-binding protein  39.52 
 
 		 466 aa  281  2e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5609  selenium-binding protein  31.32 
 
 		 607 aa  154  5e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.134626 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0317  selenium-binding protein, putative  25.54 
 
 		 459 aa  100  7e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.940405  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1226  selenium-binding protein, putative  27.49 
 
 		 440 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.331845  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1126  selenium-binding protein, putative  26.25 
 
 		 440 aa  92.4  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.789868  normal  0.636279 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>