33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1126 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_1126  selenium-binding protein, putative  100 
 
 
440 aa  898    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.789868  normal  0.636279 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1226  selenium-binding protein, putative  86.8 
 
 
440 aa  742    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.331845  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0317  selenium-binding protein, putative  66.01 
 
 
459 aa  568  1e-161  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.940405  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1311  selenium-binding protein  27.05 
 
 
448 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5609  selenium-binding protein  28.5 
 
 
607 aa  130  5.0000000000000004e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.134626 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3647  selenium-binding protein  28.39 
 
 
466 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4229  selenium-binding protein  29.24 
 
 
462 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2869  selenium-binding protein  28.18 
 
 
463 aa  108  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.74609  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0724  selenium-binding protein  27.6 
 
 
468 aa  107  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7220  selenium-binding protein  28.41 
 
 
461 aa  106  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.332846 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0336  selenium-binding protein  29.13 
 
 
463 aa  105  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0509  selenium-binding protein  26.9 
 
 
469 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0487  selenium-binding protein  26.9 
 
 
469 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.961794  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0498  selenium-binding protein  26.9 
 
 
469 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2982  selenium-binding protein  28.32 
 
 
465 aa  103  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000704485  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2414  selenium-binding protein  26.12 
 
 
468 aa  101  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000733012  decreased coverage  0.00141792 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5904  56kDa selenium binding protein  26.94 
 
 
468 aa  100  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.54154 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2621  selenium-binding protein  26.7 
 
 
468 aa  100  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2492  selenium-binding protein  26.7 
 
 
468 aa  100  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.710896  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1019  selenium-binding protein  26.65 
 
 
462 aa  99  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.240439  normal  0.354487 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0967  selenium-binding protein  27.67 
 
 
462 aa  99.4  1e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0835459  normal  0.405151 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2597  selenium-binding protein  26.94 
 
 
468 aa  98.6  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2573  selenium-binding protein  26.94 
 
 
468 aa  98.6  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1962  selenium-binding protein  26.94 
 
 
468 aa  98.6  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.84799  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0663  selenium-binding protein  27.85 
 
 
466 aa  97.1  6e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.151689  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0088  putative selenium binding protein  26.2 
 
 
468 aa  94.7  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.135423  normal  0.395764 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0524  selenium-binding protein  27.32 
 
 
461 aa  93.6  6e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.377432 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5378  selenium-binding protein  26.25 
 
 
574 aa  92.4  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4189  selenium-binding protein  26.37 
 
 
464 aa  92  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5039  56kDa selenium binding  24.79 
 
 
464 aa  91.7  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2173  putative redox protein, selenium binding  25.11 
 
 
468 aa  90.9  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2095  selenium-binding protein  24.88 
 
 
468 aa  89  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0757  selenium-binding protein  24.56 
 
 
466 aa  75.5  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.264464  normal  0.367666 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>