33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2621 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0757  selenium-binding protein  76.45 
 
 		 466 aa  745    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.264464  normal  0.367666 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0724  selenium-binding protein  93.8 
 
 		 468 aa  911    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5904  56kDa selenium binding protein  96.58 
 
 		 468 aa  939    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.54154 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2173  putative redox protein, selenium binding  85.19 
 
 		 468 aa  848    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0088  putative selenium binding protein  86.7 
 
 		 468 aa  841    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.135423  normal  0.395764 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1962  selenium-binding protein  97.44 
 
 		 468 aa  945    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.84799  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2597  selenium-binding protein  97.44 
 
 		 468 aa  945    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2492  selenium-binding protein  99.79 
 
 		 468 aa  964    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.710896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2621  selenium-binding protein  100 
 
 		 468 aa  966    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2573  selenium-binding protein  97.44 
 
 		 468 aa  945    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2095  selenium-binding protein  85.41 
 
 		 468 aa  853    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0336  selenium-binding protein  60.34 
 
 		 463 aa  589  1e-167  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4189  selenium-binding protein  58.1 
 
 		 464 aa  565  1e-160  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2982  selenium-binding protein  59.4 
 
 		 465 aa  566  1e-160  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000704485  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2869  selenium-binding protein  58.62 
 
 		 463 aa  558  1e-158  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.74609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5039  56kDa selenium binding  57.02 
 
 		 464 aa  556  1e-157  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1019  selenium-binding protein  58.28 
 
 		 462 aa  537  1e-151  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.240439  normal  0.354487 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0967  selenium-binding protein  55.94 
 
 		 462 aa  525  1e-148  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0835459  normal  0.405151 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0524  selenium-binding protein  55.6 
 
 		 461 aa  513  1e-144  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.377432 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7220  selenium-binding protein  56.22 
 
 		 461 aa  513  1e-144  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.332846 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0663  selenium-binding protein  54.31 
 
 		 466 aa  514  1e-144  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.151689  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0487  selenium-binding protein  54.84 
 
 		 469 aa  508  1e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.961794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0509  selenium-binding protein  54.84 
 
 		 469 aa  508  1e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0498  selenium-binding protein  54.84 
 
 		 469 aa  508  1e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5378  selenium-binding protein  54.26 
 
 		 574 aa  499  1e-140  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2414  selenium-binding protein  54.37 
 
 		 468 aa  479  1e-134  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000733012  decreased coverage  0.00141792 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1311  selenium-binding protein  43.83 
 
 		 448 aa  389  1e-107  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4229  selenium-binding protein  41.65 
 
 		 462 aa  329  6e-89  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3647  selenium-binding protein  42.55 
 
 		 466 aa  317  2e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5609  selenium-binding protein  31.95 
 
 		 607 aa  163  7e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.134626 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1126  selenium-binding protein, putative  26.7 
 
 		 440 aa  100  6e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.789868  normal  0.636279 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0317  selenium-binding protein, putative  26.72 
 
 		 459 aa  97.1  6e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.940405  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1226  selenium-binding protein, putative  27.34 
 
 		 440 aa  91.3  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.331845  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>