33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5039 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_2982  selenium-binding protein  67.45 
 
 
465 aa  652    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000704485  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5039  56kDa selenium binding  100 
 
 
464 aa  953    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2869  selenium-binding protein  68.39 
 
 
463 aa  656    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.74609  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4189  selenium-binding protein  73.49 
 
 
464 aa  736    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0336  selenium-binding protein  69.18 
 
 
463 aa  690    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1019  selenium-binding protein  64.59 
 
 
462 aa  632  1e-180  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.240439  normal  0.354487 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7220  selenium-binding protein  61.8 
 
 
461 aa  590  1e-167  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.332846 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0498  selenium-binding protein  59.62 
 
 
469 aa  572  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0509  selenium-binding protein  59.62 
 
 
469 aa  572  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0487  selenium-binding protein  59.62 
 
 
469 aa  572  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.961794  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0967  selenium-binding protein  58.87 
 
 
462 aa  568  1e-161  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0835459  normal  0.405151 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5378  selenium-binding protein  59.79 
 
 
574 aa  565  1e-160  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5904  56kDa selenium binding protein  57.67 
 
 
468 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.54154 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2573  selenium-binding protein  57.45 
 
 
468 aa  561  1e-158  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1962  selenium-binding protein  57.45 
 
 
468 aa  561  1e-158  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.84799  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2597  selenium-binding protein  57.45 
 
 
468 aa  561  1e-158  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0663  selenium-binding protein  60.09 
 
 
466 aa  557  1e-157  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.151689  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2492  selenium-binding protein  57.02 
 
 
468 aa  556  1e-157  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.710896  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0724  selenium-binding protein  57.45 
 
 
468 aa  556  1e-157  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2621  selenium-binding protein  57.02 
 
 
468 aa  556  1e-157  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2414  selenium-binding protein  60.3 
 
 
468 aa  543  1e-153  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000733012  decreased coverage  0.00141792 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2173  putative redox protein, selenium binding  55.39 
 
 
468 aa  543  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2095  selenium-binding protein  54.86 
 
 
468 aa  544  1e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0088  putative selenium binding protein  55.29 
 
 
468 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.135423  normal  0.395764 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0524  selenium-binding protein  56.75 
 
 
461 aa  533  1e-150  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.377432 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0757  selenium-binding protein  54.53 
 
 
466 aa  526  1e-148  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.264464  normal  0.367666 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1311  selenium-binding protein  44.71 
 
 
448 aa  385  1e-106  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4229  selenium-binding protein  40.52 
 
 
462 aa  296  4e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3647  selenium-binding protein  39.44 
 
 
466 aa  286  4e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5609  selenium-binding protein  31.29 
 
 
607 aa  171  3e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.134626 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0317  selenium-binding protein, putative  25.97 
 
 
459 aa  96.7  7e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.940405  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1126  selenium-binding protein, putative  24.79 
 
 
440 aa  91.7  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.789868  normal  0.636279 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1226  selenium-binding protein, putative  25.73 
 
 
440 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.331845  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>