19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5428 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5428  Phytanoyl-CoA dioxygenase  100 
 
 		 339 aa  687    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0395279 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3963  phytanoyl-CoA dioxygenase  48.77 
 
 		 341 aa  239  5e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.362258 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6410  Phytanoyl-CoA dioxygenase  46.1 
 
 		 326 aa  238  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8688  Phytanoyl-CoA dioxygenase  46.1 
 
 		 326 aa  238  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3918  phytanoyl-CoA dioxygenase  44.28 
 
 		 347 aa  232  6e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.117888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0322  phytanoyl-CoA dioxygenase  43.48 
 
 		 355 aa  231  1e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1839  Phytanoyl-CoA dioxygenase  45.66 
 
 		 383 aa  229  3e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1940  phytanoyl-CoA dioxygenase  43.65 
 
 		 355 aa  228  9e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8686  phytanoyl-CoA dioxygenase  42.25 
 
 		 354 aa  228  1e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1911  phytanoyl-CoA dioxygenase  45.52 
 
 		 456 aa  222  8e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8687  Phytanoyl-CoA dioxygenase  44.6 
 
 		 346 aa  217  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3760  Phytanoyl-CoA dioxygenase  44.95 
 
 		 346 aa  217  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0015  phytanoyl-CoA dioxygenase  42.28 
 
 		 346 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.349617  normal  0.130137 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4572  phytanoyl-CoA dioxygenase  35.91 
 
 		 321 aa  145  7.0000000000000006e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0888  hypothetical protein  37.11 
 
 		 300 aa  145  8.000000000000001e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.475505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1510  hypothetical protein  34.69 
 
 		 317 aa  134  1.9999999999999998e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3892  ectoine hydroxylase  26.58 
 
 		 311 aa  45.1  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2379  phytanoyl-CoA dioxygenase  31.08 
 
 		 350 aa  43.1  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1767  phytanoyl-CoA dioxygenase  31.08 
 
 		 350 aa  43.1  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>