16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3918 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_3918  phytanoyl-CoA dioxygenase  100 
 
 		 347 aa  711    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.117888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0322  phytanoyl-CoA dioxygenase  47.26 
 
 		 355 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1940  phytanoyl-CoA dioxygenase  47.26 
 
 		 355 aa  266  5.999999999999999e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8686  phytanoyl-CoA dioxygenase  46.61 
 
 		 354 aa  264  2e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3963  phytanoyl-CoA dioxygenase  50.17 
 
 		 341 aa  262  6e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.362258 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8688  Phytanoyl-CoA dioxygenase  47.17 
 
 		 326 aa  256  6e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6410  Phytanoyl-CoA dioxygenase  47.17 
 
 		 326 aa  255  7e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1839  Phytanoyl-CoA dioxygenase  46.32 
 
 		 383 aa  239  5e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5428  Phytanoyl-CoA dioxygenase  44.28 
 
 		 339 aa  232  6e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0395279 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3760  Phytanoyl-CoA dioxygenase  43.03 
 
 		 346 aa  224  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8687  Phytanoyl-CoA dioxygenase  41.18 
 
 		 346 aa  223  4e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1911  phytanoyl-CoA dioxygenase  42.9 
 
 		 456 aa  209  8e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0015  phytanoyl-CoA dioxygenase  43.96 
 
 		 346 aa  189  4e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.349617  normal  0.130137 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0888  hypothetical protein  36.04 
 
 		 300 aa  140  3e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.475505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1510  hypothetical protein  33.98 
 
 		 317 aa  133  5e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4572  phytanoyl-CoA dioxygenase  34.85 
 
 		 321 aa  125  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>