21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3963 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3963  phytanoyl-CoA dioxygenase  100 
 
 		 341 aa  677    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.362258 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3760  Phytanoyl-CoA dioxygenase  49.42 
 
 		 346 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8687  Phytanoyl-CoA dioxygenase  49.42 
 
 		 346 aa  300  3e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8688  Phytanoyl-CoA dioxygenase  54.55 
 
 		 326 aa  296  3e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6410  Phytanoyl-CoA dioxygenase  54.55 
 
 		 326 aa  296  4e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1940  phytanoyl-CoA dioxygenase  49.23 
 
 		 355 aa  293  2e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8686  phytanoyl-CoA dioxygenase  47.76 
 
 		 354 aa  291  9e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0322  phytanoyl-CoA dioxygenase  48.2 
 
 		 355 aa  291  2e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1911  phytanoyl-CoA dioxygenase  51.27 
 
 		 456 aa  288  1e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1839  Phytanoyl-CoA dioxygenase  49.68 
 
 		 383 aa  287  2e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3918  phytanoyl-CoA dioxygenase  50.17 
 
 		 347 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.117888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0015  phytanoyl-CoA dioxygenase  48.83 
 
 		 346 aa  271  1e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.349617  normal  0.130137 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5428  Phytanoyl-CoA dioxygenase  48.78 
 
 		 339 aa  243  3e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0395279 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0888  hypothetical protein  37.05 
 
 		 300 aa  159  8e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.475505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1510  hypothetical protein  36 
 
 		 317 aa  154  2e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4572  phytanoyl-CoA dioxygenase  35.18 
 
 		 321 aa  130  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2399  hypothetical protein  37.35 
 
 		 385 aa  50.8  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.127466  normal  0.479331 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1849  ectoine hydroxylase  26.64 
 
 		 302 aa  47.4  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0261  hypothetical protein  52.94 
 
 		 363 aa  43.5  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.561312 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0782  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.57 
 
 		 286 aa  43.1  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.100196  normal  0.282498 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3622  hypothetical protein  23.16 
 
 		 279 aa  43.1  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>