18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8688 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6410  Phytanoyl-CoA dioxygenase  99.69 
 
 		 326 aa  658    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8688  Phytanoyl-CoA dioxygenase  100 
 
 		 326 aa  659    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0322  phytanoyl-CoA dioxygenase  53.87 
 
 		 355 aa  299  3e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1940  phytanoyl-CoA dioxygenase  53.92 
 
 		 355 aa  297  1e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8686  phytanoyl-CoA dioxygenase  52.86 
 
 		 354 aa  296  2e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3963  phytanoyl-CoA dioxygenase  54.55 
 
 		 341 aa  296  3e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.362258 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1839  Phytanoyl-CoA dioxygenase  48.12 
 
 		 383 aa  270  2e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3918  phytanoyl-CoA dioxygenase  47.17 
 
 		 347 aa  269  5e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.117888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3760  Phytanoyl-CoA dioxygenase  47.14 
 
 		 346 aa  262  6.999999999999999e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8687  Phytanoyl-CoA dioxygenase  46.96 
 
 		 346 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1911  phytanoyl-CoA dioxygenase  48.28 
 
 		 456 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5428  Phytanoyl-CoA dioxygenase  47.02 
 
 		 339 aa  243  3e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0395279 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0015  phytanoyl-CoA dioxygenase  48.99 
 
 		 346 aa  229  4e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.349617  normal  0.130137 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1510  hypothetical protein  36.48 
 
 		 317 aa  149  5e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0888  hypothetical protein  35.39 
 
 		 300 aa  147  3e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.475505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4572  phytanoyl-CoA dioxygenase  34.2 
 
 		 321 aa  123  5e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2399  hypothetical protein  44.44 
 
 		 385 aa  45.4  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.127466  normal  0.479331 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3892  ectoine hydroxylase  22.98 
 
 		 311 aa  42.7  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>